Objectif principal : Projet multicentrique européen avec exploration multimodale du microenvironnement tumoral primitif et métastatique au travers de technologies de rupture (immunofluorescence multiplexée, séquençage whole exome).
Objectifs secondaires exploratoires du microenvironnement notamment immunitaire pour :
- Descriptif multimodale, caractérisation des couple primitif /métastasâtes appariées ; proposition d’une classification « biologique » des échantillons : identification de sous-groupes de microenvironnements à rattacher à l’évolution clinique,
- Discovery : facteurs pronostic, facteurs prédictifs de réponse et de rechute pour offrir meilleure identification des patients CCR métastatiques candidat à une chirurgie curative par exemple.
- Générer des hypothèses biologiques de recherche de transfert grâce aux analyses réalisées, et aussi grâce aux comparaisons possible avec la cohorte colon-IM (promotion CLB-CRCL : data RNAseq, scRNAseq, cytométrie en flux et mIF disponible).
Caractérisation prévue :
1-Whole Exome Sequencing bulk tumeur (blood dispo pour 36 de ces patients CLB, ils seront poolés avec d’autres blood de EORTC/SPECTA pour filtrer les variants somatiques) et RNASeq bulk : wet core lab : ALMAC, dry core lab : Institut Curie, nous récupèrerons les .vcf et matrice d’expression
2-Multiplexed IF Vectra-Polaris : 3 panels de 7 marqueurs chacun et Imaging Mass Cytometry : 2 panels de 38 marqueurs chacun : core labs : Centre hospitalier universitaire vaudois – CHUV (staining, scanning pour IF) et University of Zurich (UOZ) (staining et scanning pour IMC, phenotyping pour IF et IMC); nous récupérerons les données de phénotypage et coordonnées XY sur lame entière pour analyse (nous sommes intégrés au groupe bioimage d’IMMUCAN et nous mettons en place le groupe bioimage/biologie spatiale dans le LYRICAN+)
Données transférées :Environ 309 patients
Echantillons biologiques : blocs FFPE (309 bloc de la tumeur initiale appariés à 309 blocs de métastase) et 36 blood samples ; proposition d’envoi des échantillons par batch de 25 pts (50 blocs)
Données cliniques :
At Baseline:
- Screening: Demographic data: age and sex; Medical history, including exposure to cancer specific risk factors such as smoking history or alcohol use; Family history of cancer if available)
- Assessments around time of study entry: WHO performance status; Vital signs such as height and weight; Basic relevant lab assessment, if available (blood cell count, LDH)
- Primary disease: Primary disease information (date of diagnosis, topography, histology, common pathological information, prognostic factors and staging according to tumor type (based on AJCC latest recommendations)); Results of locally performed tumor biomarker analyses, if available
- Treatments and progression: Disease and treatment history (including response to previous anti-cancer therapies and immunotherapy related toxicity (CTCAE grade ≥3) if applicable)
At one year follow-up (after last sample was taken):
- Assessments: Survival status
- Treatments and progression: Disease status (recurrence, progression, new metastasis, with approximative date); Treatment lines (start-/end dates, surgery/radiotherapy/drug combinations, treatment intention [neo-/adjuvant, palliative]) and treatment outcome data (i.e. PFS, OS)); Enrollment in any interventional clinical research or reason why not, if applicable; New malignancy; Adverse events related to immunotherapy with CTCAE grade ≥3
Directeur Général
309 colorectal cancer patients with paired primary and metastatic FFPE material
Recherche scientifique menée dans l’intérêt légitime de lutte contre le cancer (articles 6.1.f et 9.2.j du Règlement (UE) n° 2016/679)
- Christophe CAUX, CRCL : PI
- Pierre SAINTIGNY, CLB/CRCL : co-PI
- Matthieu SARABI, oncomed CLB
- Julien BOLLARD, coordination administrative et financière
- Séverine TABONE-EIGLINGER, directrice plateforme ressources biologiques
- ARCs DMT (P Saintigny)
- Integrated BioBank of Luxembourg : stockage des échantillons, externe
- EORTC Headquarters, project management and data management teams, solution eCRF utilisée: Rave EDC (Medidata), externe
- Consortium public-privé avec industriels (ex : Owkin, Merck, Bayer, GSK, Janssen, Sanofi,..)
2 ans après la dernière publication scientifique liée au projet