Le cancer de l'ovaire, principalement le carcinome ovarien séreux de haut grade, est la tumeur gynécologique la plus mortelle. En France, environ 5 348 nouveaux cas ont été diagnostiqués en 2023. Le diagnostic est posé entre 50 et 79 ans, à un stade avancé. Les faibles taux de survie sont principalement dus à un retard de diagnostic. Sa croissance est généralement silencieuse, et les symptômes souvent non spécifiques apparaissent à des stades avancés. Le taux de survie globale à 5 ans pour une maladie à un stade avancé est inférieur à 30 %, alors qu'il est supérieur à 90 % pour une maladie de stade I. Environ 20 % des carcinomes ovariens séreux de haut grade sont liés à des mutations germinales des gènes BRCA1/2, avec une incidence de 30 à 70 %, comparer à 1,4 % dans la population générale. L'ESMO recommande une chirurgie de réduction des risques sous forme d’une annexectomie bilatérale pour les patientes présentant une mutation constitutionnelle du gène BRCA1 à l'âge de 35-40 ans et pour BRCA2 à l'âge de 40-45 ans. 

Méthode de diagnostic précoce

Même s'il s'agit de la tumeur maligne gynécologique la plus mortelle, il n'existe actuellement aucun test de dépistage validé pour le cancer de l’ovaire. En effet, les stratégies de dépistage impliquant le CA125 et l'échographie trans-vaginale n'ont pas permis de réduire de manière significative le nombre de décès en raison de leur faible sensibilité. A ce jour, il n’existe pas de stratégie de dépistage comparable à celles disponibles pour d'autres cancers, comme la mammographie pour le cancer du sein ou la combinaison du test HPV et du frottis pour le cancer du col de l'utérus. 

Le carcinome ovarien séreux de haut grade (HGSOC), qui est le cancer de l’ovaire le plus fréquent (80 % des cancer de l’ovaire) est responsable de 90 % des décès du cancer de l’ovaire. L'hypothèse actuelle de carcinogenèse décrite dans la littérature suggère que les HGSOC se développent principalement à partir de la partie distale de la trompe de Fallope, qui est anatomiquement proche du tractus génital inférieur, où des cellules tumorales ont été observées jusque sur des frottis cervicaux. Dans la quasi-totalité des cas de carcinomes ovariens séreux de haut grade, l’altération moléculaire précoce implique le gène TP53, associée à une instabilité génomique. Il semble y avoir une continuité dans la progression de la maladie, avec l'identification d'une "signature p53 tubaire" et la présence de lésions et carcinomes intraépithéliaux tubaires séreux (STIL/TIC) comme étapes précurseures. Cette progression pourrait se dérouler sur une fenêtre temporelle de plus de 6 ans avant le développement du cancer de l'ovaire.

Le diagnostic de ces cancers, basé sur la progression naturelle et la détection des altérations moléculaires dans des zones accessibles de l'appareil génital, comme le liquide cervical, est donc une piste de choix pour améliorer le taux de survie de cette maladie.

Évaluation de la mutation TP53 dans les frottis cervicaux

Plusieurs études ont démontré la possibilité de détecter précocement les carcinomes ovariens séreux de haut grade par l’analyse de l'ADN tumoral dans les échantillons de frottis cervicaux. Kinde et al. (2013) ont été les premiers à proposer cette idée et ont rapporté la présence des mêmes mutations somatiques de tumeurs de l’endomètre ou de l’ovaire dans les frottis cervicaux. D'autres études ont soutenu cette idée, en retrouvant la mutation TP53 de HGSOC sur des frottis cervicaux réalisés plusieurs années avant le diagnostic5. Ces résultats suggèrent qu'un diagnostic précoce des HGSOC est possible de manière non invasive en détectant les variants pathogènes du gène TP53 dans l'ADN extrait des frottis cervicaux. Cependant, historiquement les frottis conservés sous la forme de lames n'étaient pas destinés à une analyse de l'ADN, pouvant affecter la qualité de l'ADN en raison des procédures de prise en charge technique et de conservation. De plus, compte tenu de la faible proportion d’ADN tumoral sur les frottis, la résolution actuelle des techniques de séquençage de l’ADN nécessite de connaître au préalable les mutations TP53. Autre limite, la présence de mutations pathogènes de TP53 à faible fréquence allélique observées dans des tissus normaux dans des conditions physiologiques augmentant avec l’âge, telles que le mosaïcisme somatique ou l'hématopoïèse anormale. L’ensemble de ces raisons, ne permet pas d’envisager l’évaluation des mutations de TP53 dans les frottis cervicaux comme un outil de dépistage.

Évaluation de l'instabilité génomique dans les frottis cervicaux

En 2023, Paracchini et al. ont utilisé le séquençage complet du génome (whole genome sequencing, WGS) sur l'ADN extrait des frottis cervicaux pour détecter l'instabilité du génome, en étudiant les anomalies du profil du nombre de copies des gènes (copy number profile abnormality, CPA) afin de surmonter les limites liées à la détection des mutations de TP53. Le CPA, qui quantifie l'instabilité globale du génome même en présence d’un faible taux d’ADN tumoral, à l’aide d’un séquençage peu profond du génome (sWGS) élimine la nécessité de connaître les altérations présentent sur la tumeur. Cela en fait un outil de diagnostic rapide, robuste, économique, interprétable et résolutif pour la détection précoce du carcinome ovarien séreux de haut grade.

Leur étude rétrospective multicentrique a évalué les frottis cervicaux archivés de 250 patientes réalisés lors d’un examen gynécologique de routine (pour le dépistage du cancer du col de l’utérus). Les échantillons avaient été collectés chez 77 femmes sans diagnostic de cancer et 113 femmes chez qui avait été diagnostiqué un cancer de l’ovaire. Les valeurs de CPA sur l’ADN des frottis des patientes qui avaient développé un cancer ovarien étaient plus élevées que celles retrouvées sur le frottis des femmes sans diagnostic de cancer. Ce test a détecté avec succès la présence d’un cancer séreux de haut grade de l’ovaire jusqu’à 9 ans avant le diagnostic. Ce test atteint une sensibilité de 75% (95% CI, 64.97 to 85.79), une spécificité de 96% (95% CI, 88.35 to 100.00) et une précision de 81%. Cette étude démontre la faisabilité d'un diagnostic précoce du cancer de l’ovaire à l'aide de l'analyse de l'instabilité génomique sur sWGS dans l'ADN obtenu à partir de frottis du col de l'utérus.

Grace à ce travail, nous voulons confirmer la faisabilité du diagnostic d’un carcinome ovarien séreux de haut grade en utilisant l’instabilité génomique recherchée par sWGS sur l'ADN extrait d’un prélèvement cervical en milieu liquide, sur une série homogène de patientes prises en charge à l’IUCT-Oncopole.

Objectif Principal

L’objectif principal de cette étude est d’évaluer la faisabilité de l’analyse de l’instabilité génomique par séquençage peu profond du génome (sWGS) sur l'ADN extrait d’un prélèvement de tissu tumoral de l’ovaire et/ou d’un frottis cervical en milieu liquide pour le diagnostic d’un carcinome ovarien séreux de haut grade.

Objectif secondaire

Décrire les caractéristiques clinico-pathologiques des patientes en fonction des résultats de l’analyse de l’instabilité génomique sur les prélèvements tumoraux ovariens et cervicaux.