Mes données de santé

Le site d’informations à destination des patients traités au sein du réseau Unicancer ou inclus dans les essais cliniques du réseau Unicancer

Objectifs

Il s’agit d’un projet financé par ShapeMed 2023 pour 3 ans. Notre objectif est de constituer une suite d’analyse de données multimodales, rassemblant les données cliniques, biologiques, moléculaires, pharmacologique et de résultats d’analyse d’image, des patients du CLB (périmètre à définir avec DPO et selon les données disponibles). Nous utiliserons les sources de données structurées, ainsi que des modèles de langue afin de combiner les données et produire une donnée cible qui correspondra à un compte rendu patient enrichit (figure 1). Afin d’utiliser ces données, nous utiliserons principalement des modèles de langues pour nos projets de recherche (SAEpred, pronostic, TM2…), et possiblement une stratégie de multi–agentic workflow (inspiré de https://arxiv.org/abs/2404.04667) pour la RCP moléculaire, qui nécessiterait de requêter un ou des outils existants (comme par exemple MedSam pour l’analyse d’images) et la modélisation de phénomènes dynamiques (par exemple avec une transformation par théorie des signatures) pour réaliser cette suite d’analyses. Nous faisons l’hypothèse qu’une analyse incluant de multiples données permettra d’améliorer les performances de prédiction d’événements futurs pour les patients suivis pour un cancer (SAEpred), ou l’éligibilité aux essais cliniques (TM2 et RCP moléculaire), ou la prédiction du pronostic des patients. 

Responsable de traitement

Directeur Général 

Catégories de données utilisées
Données de santé / Données génétiques / Antécédents familiaux / Données médico-administratives / Données socio-professionnelles / Données relatives au mode de vie / Données nominatives
Origine de données utilisées
Soins
Centre Léon Bérard (Lyon)
2000
2001
2002
2003
2004
2005
2006
2007
2008
2009
2010
2011
2012
2013
2014
2015
2016
2017
2018
2019
2020
2021
2022
2023
2024
Population faisant l’objet de la recherche ou du traitement de données

Patients suivis au CLB avec plus de 4 comptes rendus et avec niveau d'information ≥5/7

Pour chaque sous-étude une intersection est prévue entre la base de données de textes et 1) les variables cliniques structurés, 2) les données moléculaires, 3) les données biologiques, 4) les données d’imageries de type scanner et éventuellement lames anapath numérisées. 

Patients avec au moins une hospitalisation au CLB de 2000 à 2024, nous pouvons mettre au point une monté en charge progressive avec par exemple un premier travail sur 10K patients et après point d’étape augmenter le nombre de patients cibles.

Fondement juridique

Recherche scientifique menée dans l’intérêt légitime de lutte contre le cancer (articles 6.1.f et 9.2.j du Règlement (UE) n° 2016/679)

Destinataires internes et externes des données

Responsable de l’équipe coordinatrice : Loic Verlingue, MD, PhD, CLB, CRCL

Equipes interne et externe 

  • ERIC Lab Lyon 2, externe, pas de demande d’accès aux données
  • Plateforme bioinformatique Synergie
Date de lancement de la recherche
24/09/2024
Durée de conservation des données

2 ans après la publication scientifique puis archivage sur un support distinct

 

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