Dans le cadre du projet BETPSY (Biomarkers in autoimmune EncephaliTis and Paraneoplastic neurological Syndromes), nous cherchons à caractériser, à l’aide de tissu tumoral, l’infiltrat immunitaire de tumeurs de patients atteints de syndromes paranéoplasiques (SNP), en particulier la diversité des cellules immunitaires, leur propriétés fonctionnelles et leur spécificités antigéniques et à identifier les protéines ciblées par les anticorps produits dans la tumeur.
Les syndromes paranéoplasiques sont des pathologies auto-immunes rares survenant chez une faible proportion de patients atteints de cancer. La particularité de cette pathologie est la production d’anticorps dirigés contre des antigènes exprimés à la fois dans la tumeur et dans le cerveau (antigènes onconeuronaux). Cependant, la spécificité antigénique des anticorps varie en fonction de la pathologie auto-immune, du type de cancer associé et n’est pas toujours connue. Les cellules responsables de la pathologie auto-immune ne sont pas non plus clairement identifiées.
Dans le but d’identifier leur présence au sein de la tumeur et le rôle des différentes populations de cellules immunitaires ainsi que des anticorps chez ces patients, nous souhaitons avoir accès aux échantillons tumoraux de patients atteints de SNP. Ainsi, nous souhaitons :
- Identifier et caractériser l’infiltrat immunitaire à partir de suspensions cellulaires de tumeurs fraiches dilacérées par cytométrie en flux, grâces aux panels multiparamétriques permettant de distinguer les différentes sous-populations immunitaires infiltrant la tumeur ainsi que les différents clonotypes d’anticorps produits par les plasmocytes.
- Comprendre d’avantage les caractéristiques moléculaires des sous-populations B grâce au séquençage d’ARN en cellules uniques couplé à un séquençage des récepteurs à l’antigène des lymphocytes T et B.
- Identifier les cibles protéiques des anticorps produits au sein de la tumeur par ELISA et utilisation de puces à protéines (Antibody profiling) à l’aide de surnageant de dilacérâts tumoraux.
- Utiliser des blocs de tumeurs fixées afin de réaliser des marquages d’immunofluorescence afin de confirmer la présence d’infiltrat immunitaire et d’analyser la structuration de cellules immunes pour mieux comprendre leurs interactions et leur fonction.
- Réaliser un suivi des patientes, analyser l’impact de l’âge, du type de pathologie associée au SNP, des caractéristiques cliniques et biologiques, d’un anticorps ciblant un antigène onconeuronal particulier ou d’un traitement anticancéreux sur la pathologie auto-immune paranéoplasique.
