Mes données de santé
The information site for patients treated within the Unicancer network or included in Unicancer network clinical trials. 

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Objectives

HE2RNA est un modèle d’apprentissage profond qui vise à prédire l'expression génétique à partir de lames histologiques.

L’objectif de ce projet est d’améliorer davantage le modèle HE2RNA en exploitant de nouveaux ensembles de données de transcriptomique à résolution spatiale (scRNAseq). L’exploitation de ces données permettra à OWKIN de former un modèle de HE2RNA plus précis et efficace pour prédire l’expression génique à partir de lames d’hématoxyline et d’éosine (H&E). En outre, des méthodes récentes dans le domaine de l’apprentissage auto-supervisé (SSL) seront utilisées pour apprendre des représentations à partir de données multimodales (histologie et données génomiques).

Data controller

Directeur Général

Categories of data used
Données de santé / Données génétiques
Origine de données utilisées
Soins
Centre Léon Bérard (Lyon)
2019
2020
2021
2022
2023
Population subject to research or data processing

Patients avec un cancer bronchique non à petites cellules (CBNPC)

21 patients au total

Critères d’inclusion :

  • Patients de 18 ans ou plus
  • Cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC) avancé
  • Traitement par immunothérapie ou chimio-immunothérapie
  • Biopsie chirurgicale disponible avant introduction de l’immunothérapie et échantillons disponibles pour faire les analyses de bulk RNAseq & de transcriptomique spatiale.
  • En situation adjuvante ou métastatique de première intention.

Critères d’exclusion :

  • Absence d’échantillons de tissus prélevés avant le démarrage de l'immunothérapie ou de la chimio-immunothérapie.
  • Opposition du patient à l’utilisation des données à des fins de recherche par un tiers industriel n’a pas été obtenue.
Legal basis

Recherche scientifique menée dans l’intérêt légitime de lutte contre le cancer (articles 6.1.f et 9.2.j du Règlement (UE) n° 2016/679)

Internal and external data recipients
  • Thomas CLOZEL, CEO, Owkin
  • Dr Aurélie Swalduz, Oncologue Poumon
  • Dr Sylvie Lantuejoul, anapath poumon
  • Valéry Attignon, plateforme biomoléculaire
  • Hugo CROCHET, DSI
  • Nicolas GADOT, plateforme anapath recherche
Research start date
29/06/2023
Data retention period

36 mois suivant la signature du Contrat soit 12 mois en base active et 24 mois en base d’archivage intermédiaire.

En fin de projet, et après la période d’archivage intermédiaire, les données mise à la disposition d’Owkin par le CLB seront supprimées de l’espace de stockage dédié.

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