L’objectif principal est d’apporter la démonstration que les cellules contenues dans le liquide pleural des patients atteints de cancer peuvent être exploité à des fins diagnostique et pronostique par la caractérisation du transcriptome des cellules isolées (single cell RNAseq).
L’objectif secondaire est de montrer que les cellules malignes contenues dans le liquide pleural peuvent permettre de développer des modèles cellulaires dérivés de patients pour mieux comprendre et anticiper les mécanismes de résistance aux traitements systémiques.
Directeur Général
Patients âgés de plus de 18 ans présentant une pleurésie et chez lesquels une ponction pleurale est réalisée à visée diagnostique dans un contexte de suspicion de pleurésie métastatique ou primitive et/ou à visée symptomatique
Nombre de patients : 40
Recherche scientifique menée dans l’intérêt légitime de lutte contre le cancer (articles 6.1.f et 9.2.j du Règlement (UE) n° 2016/679)
Coordination du projet |
-Dr Pierre Saintigny – Centre Léon Bérard – Lyon -Sandra Ortiz Cuaran - Chercheur, équipe « Analyse intégrée de la dynamique des cancers », CRCL UMR Inserm 1052 – CNRS 5286 – Centre Léon Bérard
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Collecte des échantillons |
-Unité de gestion des entrées imprévues (UGEI), Centre Léon Bérard |
Collecte des données |
-Département de médecine translationnelle, Centre Léon Bérard (Joyce Levy - Attachée de recherche clinique) |
Réception et enregistrement des échantillons |
-Plateforme de gestion des échantillons biologiques, Centre Léon Bérard |
Préparation des échantillons ? |
-Cellenion (François Monjaret, Guilhem Tourniaire) : isolement des cellules sur plaque (CellenONE), équipement localisé au Centre Léon Bérard dans le cadre d’un partenariat, puis congélation des plaques |
Analyse des échantillons |
-Envoi des plaques chez Single Cell Discoveries pour réalisation du séquençage RNA (CELLSeq2) sans données associées |
Hébergeur des données |
Centre Léon Bérard |
Analyse statistique |
-Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (équipe « Analyse intégrée de la dynamique des cancers ») -Plateforme de Bio-informatique Gilles Thomas, Centre Léon Bérard |
2 ans après la publication scientifique.
Archivage ensuite pour une durée maximale de 20 ans.