Description grand public :

L’étude porte sur l’analyse des données de séquençage à ARN (RNAseq) de patients atteints de Mesothéliomes pleuraux. Le but de l’étude est de mieux comprendre par des approches non supervisées de bioinformation et d’intelligence artificielle de stratification et de regroupements des patients, la complexité et l'hétérogénéité de cette maladie. Cela permettrait de potentiellement identifier des gènes dont l’expression est associée à une biologie particulière et donc de mieux comprendre le développement et l’agressivité moléculaire de ce type de cancer.

Description détaillée :

L’étude porte sur l’analyse des données de séquençage à ARN (RNAseq) de patients atteints de Mesothéliomes pleuraux malins appartenant à la MESOBANK. Le but de l’étude est de mieux comprendre par des approches non supervisées de bioinformation et d’intelligence artificielle de stratification et de regroupements des patients, la complexité et l'hétérogénéité de cette maladie. Cela permettrait de potentiellement identifier des gènes dont l’expression est associée à une biologie particulière et donc de mieux comprendre le développement et l’agressivité moléculaire de ce type de cancer. Les données normalisées d’expression de l’ARN messager RNAseq, fournies par le Centre Léon Bérard, seront utilisées par les équipes d’OWKIN afin de déterminer les groupes de patients aux profils d’expression géniques les plus semblables, caractérisant des sous-groupes homogènes de patients. Une analyse des gènes différentiellement exprimés dans les sous-groupes identifiés permettra ensuite de comprendre quelles sont les voies de signalisation et mécanismes cellulaires importants impliqués dans le développement de cette maladie. Ces données seront également utilisées pour corréler l’expression des gènes à leur localisation prédite sur des lames de biopsies existantes, grâce à des outils d’intelligence artificielle déjà développés par les équipes d’Owkin. Cette analyse aura pour but de mieux comprendre la géolocalisation d’expression de gènes importants pour certains patients et pouvant expliquer l'agressivité de leur maladie, leur réponse ou non aux traitements actuels ainsi que de mieux comprendre la complexité moléculaire de leur maladie.