Il s’agit d’un projet financé par ShapeMed 2023 pour 3 ans. Notre objectif est de constituer une suite d’analyse de données multimodales, rassemblant les données cliniques, biologiques, moléculaires, pharmacologique et de résultats d’analyse d’image, des patients du CLB (périmètre à définir avec DPO et selon les données disponibles). Nous utiliserons les sources de données structurées, ainsi que des modèles de langue afin de combiner les données et produire une donnée cible qui correspondra à un compte rendu patient enrichit (figure 1). Afin d’utiliser ces données, nous utiliserons principalement des modèles de langues pour nos projets de recherche (SAEpred, pronostic, TM2…), et possiblement une stratégie de multi–agentic workflow (inspiré de https://arxiv.org/abs/2404.04667) pour la RCP moléculaire, qui nécessiterait de requêter un ou des outils existants (comme par exemple MedSam pour l’analyse d’images) et la modélisation de phénomènes dynamiques (par exemple avec une transformation par théorie des signatures) pour réaliser cette suite d’analyses. Nous faisons l’hypothèse qu’une analyse incluant de multiples données permettra d’améliorer les performances de prédiction d’événements futurs pour les patients suivis pour un cancer (SAEpred), ou l’éligibilité aux essais cliniques (TM2 et RCP moléculaire), ou la prédiction du pronostic des patients. 

Principal

Concevoir et évaluer un algorithme de detection, de segmentation et de caractérisation automatique des formations ganglionnaires sur scanner TAP.

Secondaires 

Evaluation de l’interêt clinique en « vie réelle » 

Principal

The aim of our study was to evaluate the incidence of ≥ 4 pathological axillary lymph nodes in ER-positive, HER2-negative early BC patients treated by upfront surgery with SLNB and cALND grade 1-2, with involved SN by micro metastases or macro metastases ineligible for abemaciclib, according to clinicopathological criteria. Predictive factors of ≥ 4 pathological axillary lymph nodes were determined.

Secondaires 

A predictive score of ≥ 4 involved LN macro metastases was created.

Principal

Efficacite du drainage biliaire

Secondaires 

Morbidite

Complication retardée

Principal

The aim of this study was to provide sufficient evidence to validate SLNB for pT3 BC, initially cN0 usN0, in case of up-front surgery. These cases can correspond to cT3 BC or cT2 BC with pT3 tumor on final pathology. The evidence analyzed on a large cohort of patients, distinguishing four size categories, was as follows: Comparison, according to categories sizes, of false negative (FN), negative predictive values (NPV), accuracy, axillary lymph node involvement rates, and evaluation of possible completion ALND omission rates according to categories sizes.

Secondaires 

Principal

Our study aimed to assess, in a large cohort of patients, histological and clinical factors significantly associated with pN1-2 status for each tumor subtype and for patients ≤ or > 50 years with conservative breast surgery or mastectomy.

Secondaires 

We also developed a simplified score to predict macrometastases axillary lymph node involvement rates

Le but de ce projet est d’étudier le rôle du gène suppresseur de métastases NME1 dans le mimétisme vasculaire des cancers du sein. Le mimétisme vasculaire correspond au processus par lequel des cellules tumorales agressives forment un réseau qui ressemblent à des vaisseaux bien que dépourvus des cellules endothéliales. Ce réseau est fonctionnel car sang et métabolistes peuvent circuler. Ce processus pourrait expliquer pourquoi certains patients atteints de cancer sont résistants aux anti-angiogéniques.

CTIBIOTECH développe des modèles hépatiques humains par bioimpression 3D à partir de cellules du foie isolées suite à des biopsies chirurgicales prélevées sur des patients. CTIBIOTECH vise à étendre son activité par le développement de modèles en 3-dimensions du foie. Ces modèles seront produits en plusieurs copies reproductibles et permettront d'élargir les connaissances de la physiologie hépatique humaine, ainsi que d'étudier en profondeur différentes pathologies liées au foie et, par conséquent être utilisés comme outils pour le dépistage préclinique de nouveaux médicaments. 

Dans ce projet l’objectif pour la société CTIBiotech est d’adapter son processus de production par l’automatisation de la bioimpression 3D.

Ce projet scientifique vise à réaliser la dosimétrie in-vivo en protonthérapie, un domaineactuellement inaccessible. L’utilisation de l’intelligence artificielle (IA) permettra de relier lamesure des gamma prompts et des neutrons collectés en salle de traitement, aux simulationsMonte Carlo des plans de traitement. Ainsi, une dosimétrie à la volée pourra être effectuéependant les traitements en cours, une fois que le modèle neuronal sera entraîné. Deuxapplications sont prévues : l’une en PBE (protonthérapie oculaire avec MEDICYC) et l’autre enPHE (protonthérapie conventionnelle avec le ProteusOne). On pourra ainsi vérifier les dosesadministrer en cours de séance (ProtonGuard.IA). Le rationnel de l’étude repose sur lacollaboration avec un doctorant en physique de l’Université de Franche-Comté, dont jecodirige les travaux, sous la direction du Pr. Régine Gschwind et en collaboration avec le Dr.Pierre-Emmanuel Leni. Ils sont basés à Montbéliard. L’étudiant au doctorat a commencé sa thèse en janvier 2024 dans le laboratoire du Pr. Gschwind.

Objectif principal:

développer un outil de dosimétrie in-vivo en protonthérapie

Objectifs secondaires:

- Modélisaton Monte Carlo des lignes médicales de protonthérapie

-développement d'un model d'IA pour la dosimétrie en hadronthérapie

Ce projet a pour objectif, à partir d’échantillons tumoraux de patients, de développer, de caractériser et d’utiliser des modèles in vitro cellulaires (culture 2D ou tumoroïdes 3D) de cancers pédiatriques/Adolescent jeunes adultes (AJA)/adultes pour définir/comparer les mécanismes constitutifs ou induits par les traitements, à l’origine de la résistance à la mort cellulaire dans ces cancers. Les lignées pourront être partagées dans le cadre de collaborations pour leur caractérisation ou utilisation notamment pour réaliser des criblages de drogues à haut débit.