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VIR-OH–IPC 2021-022 - Impact pronostique de la détection des Herpesviridae chez les patients d’onco-hématologie en réanimation

Στόχοι

Evaluer l’impact pronostique de la détection d’un ou plusieurs Herpesviridae chez les patients d’onco-hématologie en réanimation

Υπεύθυνος επεξεργασίας δεδομένων

Institut Paoli Calmettes

232 Boulevard Sainte Marguerite

13273 Marseille Cedex 09

Κατηγορίες δεδομένων που χρησιμοποιούνται
Données d’identification (sans donnée nominative) / Données de santé
Origine de données utilisées
Soins
Institut Paoli Calmettes (Marseille)

NAC-TS-IPC 2021-026 - Neoadjuvant chemotherapy for breast cancer: clinical practice evolution and pathologic response in a French cancer center during 15 years. (NAC-TS: NAC & Tumor Size)

Στόχοι

Principal : taux de chimiothérapie néo-adjuvante et de réponse pathologique complète en fonction de la taille initiale de tumeur et en fonction des périodes et des sous types tumoraux.

 

Secondaires : taux de chirurgie conservatrice versus mastectomie totale.

Υπεύθυνος επεξεργασίας δεδομένων

Institut Paoli Calmettes

232 Boulevard Sainte Marguerite

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Données d’identification (sans donnée nominative)
Origine de données utilisées
Soins
Institut Paoli Calmettes (Marseille)
2005
2020

MAST-C-IPC 2021-024 - Complication rate and impact on adjuvant treatment processing time after mastectomy with or without immediate breast reconstruction: results on a recent large cohort during 55 months.

Στόχοι

Principal : taux de complications et facteurs prédictifs de complications en analyse multivariée.

 

Secondaires : taux de reconstruction immédiate ; score prédictif de complication ; durée d’hospitalisation ; délai de traitement adjuvant en fonction des complications ou non et des facteurs cliniques (catégorie d’âge, reconstruction immédiate ou non).

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Soins
Institut Paoli Calmettes (Marseille)
2016
2020

COVID-B6-IPC 2021-019 - Breast surgery before, during and after COVID-19 pandemic in comparison with year 2019 in a French cancer center

Στόχοι

Principal : Characteristics of new breast cancers were compared between 2019 and 2020 with distinction of three periods: before March 17 (P1), since March 17 to May 11 (P2), after May 11 to July 31 (P3) and after July 31 for year 2019. We compared also these three periods of year 2020.

Secondaires : Comparisons of breast surgical activity and ambulatory hospitalization were performed between each month of 2019 and 2020

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Soins
Institut Paoli Calmettes (Marseille)
2020

PREXscore-IPC 2021-027 – Operative prognostic scores of pelvic exenterations for gynecological cancer: when should we do the surgery?

Στόχοι

Principal

 

We determined three scores using Hazard Ratio (HR) value for each criteria in Cox model analysis, a curative predictive score, a pre-operative and a post-operative prognostic score: repartition of patients for each score and accuracy of these models by AUC (area under the ROC curve) values had been determined.

Secondaires

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MRI-liver SABR-IPC 2021-025 – Is MRI-Linac helpful in SABR treatments for liver metastases ?

Στόχοι

Principal évaluer le bénéfice d’un traitement par stéréo hépatique sur irm embarqué

 

Secondaires évaluer le taux de contrôle local

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Données d’identification (sans donnée nominative) / Données de santé
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CR-LDF-IPC 2021-020 – Robotic versus conventional latissimus dorsi-flap harvested for immediate breast reconstruction

Στόχοι

Principal

 

The primary objective of this study was to compare results of Robotic-LDF and conventional LDF (C-LDF) in terms of dorsal complication rate

 

Secondaires

Secondary objectives were to compare length of hospital stay (LHS), length of anesthesia and undertake a cost evaluation.

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232 Boulevard Sainte Marguerite

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Données d’identification (sans donnée nominative) / Données médico-administratives
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Institut Paoli Calmettes (Marseille)
2016
2020

PMLingAML-IPC 2021-028 – “Using PML nuclear body biology to identify potential AML treatment targets” (Projet Européen MSCA)

Στόχοι

Principal

Evaluer le rôle des corps nucléaires PML dans les leucémies aiguës myéloïdes (LAM) autres que la leucémie aiguë promyélocytaire (LAP).

 

Secondaires

Identifier de nouvelles cibles thérapeutiques permettant de rétablir le plein potentiel des corps nucléaires PML et donc de limiter l’acquisition de co-mutations

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Institut Paoli Calmettes

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Données d’identification (sans donnée nominative) / Données génétiques
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Soins
Institut Paoli Calmettes (Marseille)

PAC-IPC 2021-014 - La positivité des ganglions inter-aortico-caves change-t-elle la stratégie dans l’adénocarcinome pancréatique après chimiothérapie néo-adjuvante par Folfirinox

Στόχοι

Principal : Déterminer l’incidence de la découverte d’un envahissement per-opératoire des ganglions inter-aortico-cave dans cette population.

 

Secondaires : Déterminer l’impact sur la survie de l’arrêt ou non de la stratégie chirurgicale en lien avec cette découverte.

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2014
2020

HIST-IDH-IPC 2021-031 - Etude de la marque H3K27me3 HIST1 dans une population de patient avec une LAM présentant une LAM mutée pour les gènes IDH

Στόχοι

Nous souhaitons explorer la relation entre la marque épigénétique H3K27me3 HIST1 et la mutation IDH2R140. Notre hypothèse de travail est que la marque histone H3K27me3 HIST1 est secondaire à la dérégulation d’une déméthylase induite, au moins partiellement par la mutation IDH2. 

 

Pour ce faire, nous souhaitons caractériser des échantillons de patients porteurs d’une mutation sur le gène IDH2 sur lesquels nous voulons  

  1. Rechercher la présence de la marque H3K27me3 sur le locus HIST1 sur une nouvelle cohorte de patients non mutés pour le gène NPM1. Pour ce faire nous avons besoin de cellules congelées en DMSO à partir desquelles nous réaliserons une analyse de la chromatine par une technique de ChIP-QPCR. Dans cette partie, nous allons également avoir besoin de contrôle (patients NPM1mut/IDHwt, patients NPM1mut/IDH2mut, patients IDH1mut…) 
  1. Analyser l’effet de l’enasidenib sur la marque H3K27me3 HIST1. En effet, si notre hypothèse de travail est exacte, la drogue, en réduisant la quantité de 2HG présente dans la cellule devrait réactiver les enzymes impliqués dans la méthylation des histones et modifier le profil épignétique au niveau de notre locus d’intérêt. 

 

Techniques mises en oeuvre

ChIP-qPCR : l’ADN préalablement crosslinké et soniqué  est immunoprécipité à l’aide d’un anticorps a-H3K27me3 (Abcam 2002). L’ADN est purifié, une PCR quantitative est réalisée avec des oligonucléotides permettant l’amplification de régions ciblées au locus HIST1 ; les enrichissements en marques H3K27me3 seront définis par rapport aux quantités d’amplicons obtenus sur ces mêmes régions en utilisant une chromatine immunoprécipitée à l’aide d’un anticorps non spécifique pour les IgG. Des contrôles positifs et négatifs pour l’H3K27me3 sur des régions préalablement validées seront utilisés en contrôle.  

Cultures cellulaires et cytométrie en flux: les blastes primaires seront isolés sur la base de leur imunophénotype (SSClow,CD45int) (plateforme de cytométrie du CRCM) puis cultivés in vitro sur une période de 9 jours jusqu’à expression de marqueurs de différenciation myélomonocytaire (CD24, CD15, CD14, CD16) en présence d’enasidenib/AG-220 ou de son excipient (DMSO), tel que précédemment rapporté (8).  

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Institut Paoli Calmettes (Marseille)