Mes données de santé
The information site for patients treated within the Unicancer network or included in Unicancer network clinical trials. 

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Objectives

Pour ce projet, des patients fumeurs/buveurs et non-fumeurs/non buveurs traités pour des carcinomes épidermoïdes de la cavité buccale ont été sélectionnés afin d’étudier  la carcinogénèse de leurs tumeurs et d’analyser les variantes structurelles de leur ADN tumoral, en comparant les données des patients  fumeurs/buveurs versus non-fumeurs/non buveurs. Les données seront obtenues grâce à une technologie permettant de caractériser les variants structuraux de l’ADN tumoral qui sera réalisées par BIONANO.

En parallèle, 4 de ces échantillons seront analysés par WGS (séquençage du génome entier) au CLB afin de comparer ces 2 technologies.

Pour donner de la puissance à cette comparaison pour ces 2 approches, 3 échantillons d’adénocarcinomes mammaires amplifiés HER2+, seront inclus à cette analyse. Dans un second temps, s’il reste suffisamment de matériel, une analyse en RNA Seq pourra alors être effectuée et les données seront traitées par la plateforme de bio-informatique du CLB.

Data controller

Dr Pierre Saintigny

Categories of data used
Données de santé / Données génétiques
Origine de données utilisées
Soins
Centre Léon Bérard (Lyon)
2006
2007
2008
2009
2010
2011
2012
2013
2014
2015
2016
Population subject to research or data processing

17 patients incluant des fumeurs/buveurs et non-fumeurs/non buveurs qui ont été traités pour un carcinome épidermoïde de la cavité buccale.

3 patientes traitées pour un adénocarcinome du sein, HER2+.

30 mg par patients de tumeur congelée dans  un cryotube de 1.8ml issu de la tumorothèque du CRB sera envoyé à BIONANO.

Si il reste du matériel tumoral après l’envoi à BIONANO, il est envisagé de faire du RNA Seq au CLB, le CRB sera en charge d’extraire les ARNs.

Legal basis

Recherche scientifique menée dans l’intérêt légitime de lutte contre le cancer (articles 6.1.f et 9.2.j du Règlement (UE) n° 2016/679)

Recherche scientifique menée dans l’intérêt public dans le domaine de la santé publique (articles 6.1.e et 9.2.i du Règlement (UE) n° 2016/679)

Internal and external data recipients

Dr Pierre Saintigny, coordination du traitement

Alain Viari, en charge de l’analyses bio-informatique et du traitement des données si RNAseq

Bionano Gemomics, sous-traitant externe

Research start date
14/01/2020
Data retention period

2 ans

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