Le diagnostic histopathologique du mésothéliome malin reste dans plusieurs cas un défi, malgré les avancées realisées grace à l'implémentation d'analyses moléculaires (FISH, RNAseq) dans la procédure de diagnostic.

Nous souhaitons valider la possibilité d'utiliser l'analyse de la variabilité des ribosomes comme une couche supplémentaire pour aider au diagnostic du mésothéliome.

Plusieurs études ont mis en évidence que les fonctions des ribosomes sont altérées dans les cellules cancéreuses et que les ribosomes peuvent soutenir des fonctions oncogéniques (Bastide et al 2018). La fonction des ribosomes peut être modulée par des variations dans les protéines ribosomiques mais aussi dans les ARN ribosomiques. En particulier, il a été démontré que les changements dans le schéma de méthylation du 2'O-ribose de l'ARN ribosomique (ARNr 2'OMe) jouent un rôle clé dans la régulation de la traduction. En effet, l'ARN ribosomal comporte 106 sites de méthylation qui peuvent être méthylés de manière différentielle, modulant ainsi les capacités intrinsèques des ribosomes à engager des ARNm contenant des IRES (Marcel et al 2013). L'utilisation du motif 2'OMe de l'ARNr pour classer des types de tumeurs spécifiques a été utilisée avec succès pour le cancer du sein (Marcel et al 2020) et pour les gliomes diffus de type adulte de haut grade (HGG) (Paraqindes et al 2023).

Nous supposons que cette approche aidera au diagnostic différentiel du mésothéliome dans les cas restant incertains après la procédure de diagnostic classique.

Dans l'étude pilote, nous aimerions valider la possibilité de distinguer les 3 principaux sous-types de mésothéliome en examinant exclusivement le motif 2'OMe de l'ARNr et de construire un modèle de mésothéliome.

L’équipe du professeur Lantuejoul sera le resposable de traitement global des données.

L’objectif principal de cette étude de cohorte rétrospective multicentrique française est, de déterminer le bénéfice clinique obtenu chez les patients atteints de mélanome métastatique chez qui une thérapeutique a pu être introduite, à la suite de la mise en évidence d’une altération moléculaire ciblable (à l’exclusion des mutations BRAF, NRAS, CKIT), via les nouvelles techniques de biologie moléculaire.

Les objectifs secondaires seront de :

 - Dresser un panorama des stratégies de tests de biologie moléculaire utilisés en France dans le mélanome en 2022

-Déterminer la proportion de tests (en fonction du type de test et du matériel utilisés) parmi ceux réalisés ayant identifié, une ou des altérations moléculaires ciblables - Etudier la concordance sanguine et tissulaire et l’évolution longitudinale au cours du temps des altérations moléculaires mises en évidence

L’objectif est d’évaluer l’expression des rétrovirus endogènes et notamment les membres de la famille HML-2 contenant des épitopes cibles mis en évidence par notre équipe (Bonaventura et al. 2022; Alcazer et al. 2022). Nous rechercherons des signatures transcriptomiques associées à cette expression, avec une analyse préférentielle des signatures immunes. Le rôle pronostique ou prédictif sera analysé en fonction des données disponibles.

ErVimmune est spécialisée dans la recherche, le développement et la commercialisation de thérapies cellulaires à base de lymphocytes T modifiés (TCR-T cells) et de vaccins thérapeutiques de nouvelle génération, ciblant de nouvelles familles d’antigènes tumoraux non-conventionnels dérivés des rétrovirus endogènes humains (human endogenous retroviruses ou HERVs).

Les HERVs résultent d'anciennes infections rétrovirales et représentent une part substantielle du génome humain (8 %). Epigénétiquement réduits au silence dans les cellules normales, les gènes HERV sont réactivés et anormalement exprimés dans plusieurs types de tumeurs et sont à l’origine du déclenchement de réponses immunitaires. ErVimmune a réalisé une percée scientifique majeure en montrant que seul un nombre limité de HERV sont exprimés de manière anormale dans certaines tumeurs. Nous avons pu identifier les régions communes partagées entre ces HERV spécifiques et déterminer les épitopes partagés par les cellules tumorales présents dans ces domaines. L’approche de ErVimmune a établi pour la première fois que les antigènes dérivés des HERVs représentent une source d'antigènes tumoraux spécifiques capables d'induire une forte réponse immunitaire et exprimés avec une sélectivité tumorale élevée dans différents types de tumeurs et partagés entre les patients.

Cette approche repose sur une méthode bioinformatique propriétaire innovante (Figure 1) pour l'identification et la sélection des cibles antigéniques tumorales dérivées des HERVs les plus prometteuses.

Dans le cadre du projet MYPROBE, des RNAseq ont été réalisés sur des patientes atteinte d’un cancer du sein triple négatif à haut risque de rechute. Ces données ont permis d’identifier des signatures immunes associées qui ont été corrélées à des paramètres clinico-biologiques des patientes.

Nous souhaiterions pouvoir analyser les données issues des RNAseq afin d’analyser l’expression des HERVs et de pouvoir les associer aux signatures immunes.

Recueil du nom du centre, sexe, date de décès/dernières nouvelles, date de fin de l’Imatinib, date de début d’autres lignes de traitement en rapport avec les GISTs pour chaque patient ayant été inclus dans l’étude BFR14, réalisation de chirurgie des métastases, date de chirurgie des métastases, statut post-chirurgical, statut mutationnel des GISTs.

L’objectif est d’étudier l’impact du profil génomique sur la survie globale des patients mais également la survie sans progression (PFS), le temps de résistance à l’imatinib (TTIR) et aux autres traitements des GISTs chez les patients inclus dans le BFR14

• Décrire les consultations systématiques à baseline pour information éducative , puis systématique pour démasquer les toxicité en aigue, retardées ou chronicisées
• Description globale des toxicités liées à l’io (pembrolizumab) rencontrées, plutôt sur la versant du circuit de  gestion de celles-ci que de leur description détaillée qui fait l’objet d’un autre travail 
• Recourt à un spécialiste d’organe

Décrire nos pratiques de prise en charge dans le cadre de l’immunothérapie (pembrolizumab)

Démasquer les toxicités aiguës, retardées ou chronicisées

Description globale des toxicités rencontrées, liées à l’immunothérapie

Etude rétrospective monocentrique évaluant le taux de complication et le taux de positivité des biopsies pulmonaires sous guidage scanographique réalisées au Centre Léon Bérard des suites d’un changement de matériel biopsique avec augmentation de calibre du matériel biopsique. Nous évaluerions l’impact de 3 types de dispositifs de calibre distincts entre 2020 et 2023.

L’objectif principal est d’évaluer le taux de complication post biopsie pulmonaire en fonction du matériel biopsique utilisé.

Les objectifs secondaires sont d’étudier :

- la durée d’hospitalisation des patients post biopsie pulmonaire en fonction du dispositif de biopsie utilisé ;

- la positivité de l’étude anatomopathologique sur le matériel biopsique en fonction du dispositif utilisé   ;

- la possibilité d’analyse de biologique moléculaire sur le matériel biopsique en fonction du dispositif utilisé.

L’objectif de ce projet et d’étudier les inégalités sociales pour les différentes étapes du parcours de chirurgie après un cancer du sein. Il s’agira dans un premier temps d’étudier les inégalités sociales dans le type de chirurgie (conservatrice ou mastectomie) puis dans la réalisation d’une reconstruction mammaire immédiate parmi les femmes ayant eu une mastectomie

OBJECTIF PRINCIPALRelation entre les informations métaboliques obtenues par TEP au [18F]FDG des glandes salivaires principales et la fonction salivaire 12 mois après la radiothérapieOBJECTIFS SECONDAIRESRelation entre les informations métaboliques obtenues par TEP au [18F]FDG des glandes salivaires principales et la fonction salivaire obtenue par scintigraphie des glandes salivaires 

Déterminer de manière rétrospective la durée de contrôle de la maladie et la survie après un traitement par TPEx chez les patients atteints d’un cancer ORL récidivant ou métastatique.  

NB : Cette étude, réalisée à partir des éléments déjà renseignés dans le dossier médical, dans l'établissement de prise en charge, ne présente aucune contrainte ni aucun risque. En savoir + : voir note d'information ci dessous.