Diagnostics Prévention et traitement Prise en charge des patients

Prouver que les indices de texture améliorent la prédiction d’un modèle (type régression logistique) par rapport aux indices conventionnels.

Objectif : Identifier les facteurs prédictifs de la survie globale chez les patients atteints de métastase(s) musculaire(s) d’un cancer du rein.

Critères d’évaluation principal Survie globale 1 (SG 1) au stade métastatique musculaire : définie comme l’intervalle de temps entre la date de l’apparition de métastase(s) musculaire(s) et la date de décès quelle que soit la cause. Les patients perdus de vue et les patients vivants sont censurés à la date de dernières nouvelles.

Critères d’évaluation secondaires - Survie globale 2 (SG 2) définie comme l’intervalle de temps entre la date du diagnostic initial de carcinome rénal et la date de décès quelle que soit la cause. - Survie globale 3 (SG 3) au stade métastatique : définie comme l’intervalle de temps entre la date de l’apparition de métastase(s) quelle que soient leur localisation et la date de décès quelle que soit la cause. - Survie sans métastase musculaire 1 (SSMM1) : intervalle de temps entre la date du diagnostic initial et la date de découverte de métastase(s) musculaire(s). - Survie sans métastase musculaire 2 (SSMM2) : intervalle de temps entre la date du diagnostic de maladie métastatique et la date de découverte de métastase(s) musculaire(s). - Survie sans progression musculaire (SSPM) : intervalle de temps entre la date de découverte de métastase(s) musculaire(s) et la date de première progression métastatique musculaire (locale, distante [mesure de la maladie selon les critères RECIST v1.1]) ou décès quelle que soit la cause. Les patients perdus de vue et les patients vivants sans progression musculaire sont censurés à la date de la dernière évaluation. - Survie sans progression (SSP) : intervalle de temps entre la date de découverte de métastase(s) musculaire(s) et la date de première progression métastatique quel que soit le site de progression (locale, distante [mesure de la maladie selon les critères RECIST v1.1]) ou décès quelle que soit la cause. Les patients perdus de vue et les patients vivants sans progression musculaire sont censurés à la date de la dernière évaluation. - Décrire les modalités diagnostiques ayant révélé la(les) métastase(s) musculaire(s) définie comme l’examen clinique, l’imagerie médicale (quel type), l’examen anatomopathologique. - Décrire le taux de réponse objective (RECIST 1.1) après traitement local de la (des) métastase(s) musculaire(s) défini comme le pourcentage de patients en réponse complète ou partielle après traitement local. - Décrire le taux de réponse objective après traitement systémique de la (des) métastase(s) musculaire(s) définie comme le pourcentage de patients en réponse complète ou partielle après traitement systémique. - Décrire les traitements anticancéreux locaux ou systémiques reçus par le patient : leur durée, et leur activité définie par le taux de réponse. - Décrire les toxicités graves des traitements anticancéreux locaux reçus pour la (les) métastase(s) musculaire(s)

Critères d’évaluations exploratoires :

- Identifier des biomarqueurs solubles, génomiques et tissulaires prédictifs de la sensibilité ou de la résistance des métastases musculaires aux traitements reçus. - Décrire avec plus de précision l’histoire naturelle des métastases musculaires de cancer du rein à travers le pool de cette base de données et d’autres bases de données décrivant des métastases musculaires de cancer du rein.

Un des objectifs secondaires de l’étude EXPRESS est de caractériser l’environnement immunitaire des répondeurs exceptionnels (présentant une PFS médiane supérieur à 3 fois la PFS rapportée dans les essais pivotaux).

L’environnement immunitaire des répondeurs exceptionnels sera comparé à l’environnement immunitaire de patients contrôles (PFS médiane telle que rapportée dans les essais pivotaux). Pour cela des marquages multiplexés en immunofluorescence seront réalisés afin de caractériser l’infiltrat immun général (macrophages, lymphocytes T régulateurs, cellules B etc), ainsi que les TLS et les plasmocytes et le degré d’activation des lymphocytes T.

Participer à la collection clinico-biologique de la FFCD des tumeurs avec mutations de l’ADN polymérase (PolE ou POLD).

Estimer la survie sans progression (PFS) chez les patients porteurs d’un adénocarcinome du pancréas localement évolué non opérable traité par chimiothérapie première type Folfirinox ou Gemcitabine puis traité par radiothérapie (+/- chimiothérapie concomitante) de clôture

L’adénocarcinome pulmonaire est le sous-type le plus fréquent de cancer du poumon. Il affecte le plus souvent les fumeurs, mais peut aussi se développer chez les non-fumeurs, et représente ainsi le type de cancer du poumon observé le plus fréquemment chez des personnes jeunes n’ayant jamais fumé. La chirurgie constitue le traitement de référence de ce type de cancer, mais la plupart des cas sont diagnostiqués à un stade avancé ou métastatique et ne sont donc pas opérables.

Depuis la découverte en 2004 du rôle des mutations activatrices du récepteur à l’EGF (Epidermal Growth Factor), et plus récemment des réarrangements des gènes ALK, ROS1 et RET, le pronostic des carcinomes tend à s’améliorer avec le développement des thérapies ciblées. Un traitement par thérapie ciblée est efficace chez la grande majorité des patients, induisant une régression de la tumeur. Cependant, les réponses obtenues sont très hétérogènes suivant les patients, et systématiquement des résistances au traitement apparaissent, provoquant une rechute.

Le projet PROFUSION vise à identifier et caractériser des biomarqueurs d’intérêt pronostic et/ou prédictif de la réponse au traitement ou de l’apparition d’une résistance par des techniques d’étude de profilage du transcriptome (RNA-seq) et de profilage spatial de panels de protéines d’intérêt (GeoMx Digital Spatial Profiling (DSP, NanoString)) d’une cohorte d’échantillons présentant des différentes altérations moléculaires.

La phase test du projet porte sur 8 échantillons, 4 tumeurs porteuses d’un réarrangement du gène ALK, et 4 tumeurs porteuses d’une mutation du gène EGFR.

Comparaison entre hommes et femmes des durées de vie à partir du début de leur prise en charge pour cancer du sein.

L'étude vise à comparer les caractéristiques morphologique, transcriptomique et épigénétique (par profilage du méthylome) d’une cohorte collaborative

L'objectif est d'étudier certains types de marqueurs présents au cœur de la tumeur et leur action sur certaines cellules de l'immunité (les macrophages) également présentes dans la tumeur. Ceci se fait sur l'échantillon de tumeur qui a été prélevé lors de la biopsie de diagnostic. Il s'agit de comprendre comment ils interagissent et si cela permet de créer des catégories de situations qui constitueraient des groupes de patients de pronostics différents et donc nécessitant des prises en charge différentes.