Mes données de santé

Le site d’informations à destination des patients traités au sein du réseau Unicancer ou inclus dans les essais cliniques du réseau Unicancer

À propos de ce site

Objectifs

L’objectif de cette étude est de mettre au point un protocole permettant d’accéder à l’expression des gènes à l’échelle de chaque noyau indépendamment. L’expression des ARNm des noyaux permet d’avoir une estimation de l’activité transcriptomique cellulaire, et donc du fonctionnement des cellules.

Ces informations d’expression des ARNm sont ensuite analysées bioinformatiquement afin de déterminer les types cellulaires présent dans l’échantillon et estimer le fonctionnement des cellules tumorales, normales et des cellules du microenvironnement.

En pratique, la mise au point a été réalisée à partir de blocs fixés et inclus en paraffine reçu par la plateforme 3DOnco pour leur projet de recherche de générations d’organoïdes. Nous avons ciblé ces échantillons pour la mise au point de ce protocole car il est important de trouver des possibilités pour comparer l’activité transcriptomique des cellules présentes dans les organoïdes avec celles présentes dans l’échantillon original.

Responsable de traitement

Directeur Général

Catégories de données utilisées
Données de santé
Origine de données utilisées
Soins
Centre Léon Bérard (Lyon)
2021
2022
2023
Population faisant l’objet de la recherche ou du traitement de données

3 patients pour lesquels du tissu frais a été reçu par la plateforme 3DOnco dans le cadre du projet CMT n° 2022-05, 2021-33 et 2021-19) pour lesquels une partie des fragments a été fixée et incluse en paraffine.

Fondement juridique

Recherche scientifique menée dans l’intérêt légitime de lutte contre le cancer (articles 6.1.f et 9.2.j du Règlement (UE) n° 2016/679)

Destinataires internes et externes des données

Cyril Degletane (Plateforme de Génomique des Cancers) : technique Single Cell et analyse

Interne CLB_CRCL :

  • Plateforme PEXVIVO : logistique tumeurs fraîches, vérification de l’info patient et transmission données associées
  • Plateforme 3DONCO ; préparation des échantillons
Date de lancement de la recherche
30/06/2023
Durée de conservation des données

Les recommandations de la CNIL seront suivies : La CNIL recommande 2 ans après la publication scientifique puis archivage sur un support distinct

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