Principal

Développer et valider un modèle prédictif de survenue de pneumothorax après biopsie pulmonaire percutanée incluant des paramètres de radiomics.

Secondaire

Comparer l'efficacité de ce modèle à celle d'un modèle classique (n'incluant pas la radiomics)

Etude rétrospective descriptive des données cliniques et biopathologiques des patients pris en charge au CLB pour un sarcome à cellules claires.

Evaluation d’une chimiothérapie administrée après inhibiteurs de point de contrôle immunitaire pour un carcinome urothélial avancé ou métastatique

L’objectif est de comparer l’efficacité de 2 méthodes diagnostiques, la biopsie chirurgicale et la microbiopsie percutanée, dans les lymphomes de Hodgkin en pédiatrie. Nous évaluons aussi la faisabilité et l’aspect sécurité des 2 méthodes (durée d’hospitalisation, procédure en externe/ hospitalisation, douleurs, type d’anesthésie, complication). Enfin, nous évaluons les facteurs influençant l’efficacité des microbiopsies radiologiques (taille de l’aiguille de biopsie, localisation, nombre de biopsies).

Savoir si l’épidémie de COVID 19 n’a pas entrainé un retard au diagnostic du cancer du sein durant la période de confinement.

Montrer l’efficacité du tamoxifène et d’un inhibiteur de PRMT5 sur la croissance tumorale

Longtemps considéré comme un acteur passif dans le processus de synthèse protéique, il apparaît aujourd’hui que le ribosome participe de manière très directe à la régulation traductionnelle. Ainsi, des ribosomes présentant des compositions moléculaires différentes possèdent des activités traductionnelles distinctes en fonction des conditions physiopathologiques, y compris dans certains cancers. Notre équipe s’intéresse aux variations de composition du ribosome qui surviennent au niveau des modifications chimiques des ARN ribosomiques (ARNr), en particulier des 106 sites de 2’O-ribose méthylation (2’Ome). Nous avons montré pour la première fois que, la 2’Ome des ARNr varie dans les cancers du sein. En effet, nous avons récemment analysé la 2’Ome des ARNr dans une série de 195 tumeurs primaires mammaires par RiboMETH-seq. Cette analyse représente le premier profilage de la 2’Ome des ARNr chez l’Homme (Marcel et al, NAR Cancer 2020). Dans cette étude, nous avons montré que non seulement la 2’Ome des ARNr varie chez l’Homme, mais aussi qu’il existe une association entre le niveau de 2’Ome des ARNr à certains sites et des caractéristiques biologiques et cliniques clés. En particulier, le niveau de 2’Ome est significativement différent à certains sites en fonction du statut ER (récepteur œstrogène), du sous-type intrinsèque (luminal vs. triple négatif) ou encore du grade de la tumeur. De plus, les patientes porteuses d’une tumeur présentant une hypo-méthylation des ARNr sur certains sites présentent une survie plus faible. L’ensemble de ces données soutient la notion que la 2’Ome des ARNr reflète l’hétérogénéité inter-tumorale mammaire et pourrait contribuer aux développements des cancers du sein, de son initiation à sa progression métastatique. L’objectif dans lequel s’inscrit l’analyse des échantillons qui font l’objet de la présente demande est de comprendre comment la 2’Ome contribue à la physiopathologie des cancers d’une manière plus large.

 Les objectifs de notre projet sont de :

(1) Identifier les différents profils de 2’Ome des ARNr survenant dans les cancers

(2) Déterminer l’association entre ces profils de 2’Ome et les caractéristiques cliniques des patients, en particulier avec les résistances aux traitements et la maladie métastatique

(3) Caractériser les différents profils de 2’Ome des ARNr survenant dans les cancers en terme de fonctions biologiques

Evaluer dans la population de patients avec IRM corps entier initiale, la proportion de patients présentant des localisations métastatiques synchrones au diagnostic et comparer les caractéristiques des patients avec versus sans métastases synchrones :

• Données démographiques (âge, sexe)
• Localisation de la tumeur primitive
• Taille tumorale de la tumeur primitive (≤ 5 cm // > à 5 cm)
• Grade (1/2/3)
• Présence de cellules rondes (oui/non)
• Topographie de la tumeur primitive (superficielle/profond)

- Décrire les localisations métastatiques : site des lésions ; diagnostic clinique ou radiologique simple versus diagnostic à l’IRM corps entier seulement ?

- Décrire la prise en charge de ces patients (traitements, chirurgie)

- Décrire la survie sans récidive/progression des patients présentant un liposarcome myxoïde selon la présence ou non de métastases synchrones au diagnostic, en particulier le risque de métastases au cours du temps (= métachrones), ainsi que les localisations de ces nouvelles lésions par ordre d’apparition

-Décrire la survie globale des patients présentant un liposarcome myxoïde selon la présence ou non de métastases synchrones au diagnostic

Faisabilité avant étude plus large dans le cancer du canal anal.

Phase validation du traitement pré-analytique et de la technique des échantillons sanguins pour la détection et le monitoring de HPV16

Comparer la survie sans évènement (SSE) des patients qui n'ont pas atteint une réponse pathologique complète (pCR) selon l'ypT, l'ypN et plusieurs facteurs analysés dans l'essai Katherine; Comparer la survie globale des patients qui n'ont pas atteint une réponse pathologique complète (pCR) selon les mêmes variables.