L’objectif du projet est de développer des outils de reconnaissance automatique des cancers pulmonaires sur les scanners thoraciques de patients suivis pour un cancer pulmonaire. Pour cela, il faut créer une base de données en segmentant des tumeurs sur les scanners anonymisés qui servira à l’apprentissage automatique par Deep Learning. Les outils de reconnaissances des tumeurs doivent permettre de détecter automatiquement les cancers du poumon, afin d’augmenter les performances diagnostiques de radiologues et de diminuer leur temps d’interprétation. Enfin, l’outil développé devra également proposer une caractérisation histologique de la tumeur.

Etude observationnelle rétrospective, monocentrique évaluant 2 méthodes d’immobilisation du patient en radiothérapie stéréotaxique pulmonaire :

• Utilisation d’une contention rigide personnelle (Bluebag®) et,
• Utilisation d’une contention non personnelle et non spécifique (non rigide) avec un Posirest ®, dans les traitements de SBRT pulmonaire chez des patients présentant une tumeur broncho-pulmonaire primitive (T1-T2 N0 M0) et des métastases broncho-pulmonaires avec primitif contrôlé. L'objectif principal de cette étude est d'évaluer l’efficacité de l’installation avec un Posirest® sur le décalage intra-fraction par rapport à l’installation personnalisée grâce à un matelas « Blue Bag » chez des patients traités par radiothérapie stéréotaxique pulmonaire. Les objectifs secondaires sont d’évaluer dans les 2 cohortes :
• Le taux de décalages intra-fraction ≤ 1 mm (translation dans toutes les directions) et ≤ 1° (rotation dans toutes les directions) ;
• Le décalage inter-fraction ;

L'impact de l'IMC, le PS et l'âge du patient sur les performances de la contention en termes d'immobilisation

L’objet du traitement des données est de répondre à la demande de l’INCA dans le cadre des tumeurs des surrénales (COMETE)  concernant la file active des patients vus pour cette pathologie

L’objet du traitement des données est de répondre à la demande de l’INCA dans le cadre des tumeurs thyroïdiennes réfractaires (TUTHYREF) concernant la file active des patients vus pour cette pathologie

Développement et évaluation d’outils d’aide au diagnostic différentiel entre pneumopathie radique et maladie néoplasique localement évolutive sur l’examen TEP/TDM au 18F-FDG à trois mois de la fin de la radiothérapie de cancers broncho-pulmonaires non à petites cellules.

Développer et évaluer des outils d’aide au diagnostic permettant de différencier pneumopathie radique et poursuite évolutive locale sur la TEP/TDM à 3 mois de la fin de la radiothérapie de carcinomes broncho-pulmonaires.

Recueil de données dans le cadre d’une thèse d’exercice de médecine en cancérologie

Analyse  rétrospective des séquences thérapeutiques concernant les patients porteurs d’adénocarcinomes bronchiques mutés EGFR métastatiques cérébraux au diagnostic.

Comparaison des données concernant les médicaments par inhibiteurs de tyrosine kinase de l’EGFR et la radiothérapie cérébrale.

• Décrire les modalités d’évaluation de la douleur dans l’établissement
• Identifier les limites à l’évaluation de la douleur chez les patients non communicants accueillis à l’ICL
• Mettre en place des mesures d’optimisation de l’évaluation de la douleur dans cette population

Colliger les données cliniques disponibles pour établir des corrélations avec les résultats d’expériences obtenues

Le traitement des données s’intègre dans un projet de recherche à caractère d’intérêt public portant sur l’identification d’une nouvelle cible thérapeutique chez des patients atteints de synovialosarcomes (SS) métastatiques.

La société NETRIS Pharma développe actuellement un anticorps dirigé contre la nétrine-1 (NP-137). Une étude antérieure portant sur une petite série de cas a démontré que la nétrine-1 est exprimée par les SS. L’objectif est de déterminer la prévalence de l’expression de la nétrine-1 dans une plus grande série de cas de SS, ainsi son impact pronostique.

 Cette étude se greffe à l’étude GSK-SS-NYESO1, dont le traitement a déjà été validé le 29/11/2019 et enregistré sous le numéro R201-004-012. La présente étude utilisera exactement les mêmes données et les mêmes échantillons que l’étude GSK-SS-NYESO1.

 Pour rappel, les données cliniques et échantillons tumoraux d’environ 160 patients atteints de SS métastatiques et référencés dans la base de données Conticabase (coordonnée par le Groupe Sarcome Français) seront collectés.

Les données seront collectées par un Attaché de recherche clinique à partir du dossier médical des patients des centres Français du groupe sarcome. Les données moléculaires seront générées par les techniques prévues par le projet. Les données pseudoanonymisées (code de 6 caractères pour identifier le patient) seront collectées dans la base sarcome (déclaration CNIL 2211136 v 0), puis analysées par l’équipe de biostatistique de la DRCI du CLB. Un rapport statistique final sans donnée individuelle sera transmis au laboratoire GSK, partenaire de ce projet.

Pour ce projet, des patients fumeurs/buveurs et non-fumeurs/non buveurs traités pour des carcinomes épidermoïdes de la cavité buccale ont été sélectionnés afin d’étudier  la carcinogénèse de leurs tumeurs et d’analyser les variantes structurelles de leur ADN tumoral, en comparant les données des patients  fumeurs/buveurs versus non-fumeurs/non buveurs. Les données seront obtenues grâce à une technologie permettant de caractériser les variants structuraux de l’ADN tumoral qui sera réalisées par BIONANO.

En parallèle, 4 de ces échantillons seront analysés par WGS (séquençage du génome entier) au CLB afin de comparer ces 2 technologies.

Pour donner de la puissance à cette comparaison pour ces 2 approches, 3 échantillons d’adénocarcinomes mammaires amplifiés HER2+, seront inclus à cette analyse. Dans un second temps, s’il reste suffisamment de matériel, une analyse en RNA Seq pourra alors être effectuée et les données seront traitées par la plateforme de bio-informatique du CLB.