Avec le projet SPARK, nous évaluerons la faisabilité d’utiliser le séquençage de l'ARN unicellulaire (scRNA-seq) dans un délai compatible avec la décision clinique et l'orientation thérapeutique, chez des patients atteints de tumeurs solides. Nous étudierons également son potentiel à guider les décisions de traitement en fonction de l'expression cible, de la cellule tumorale et de la caractérisation moléculaire du TME. Nous comparerons cette approche avec le profilage moléculaire plus large que nous mettons en œuvre dans le cadre de l’étude ProfiLER.

Cette recherche  part du constat clinique suivant : les cancers de l’endomètre restent une pathologie avec peu d’options thérapeutiques en particulier les cancers de type MSS et en cas de rechute (stabilité des microsatellites= réparation ADN normal). 

Son objectif principal est de mieux comprendre la biologie de la cible thérapeutique B7H4 (protéine à la surface des cellules tumorales) fortement exprimée dans les cancers de l’endomètre et les conséquences biologiques de son engament avec un candidat médicament (anticorps anti-B7H4 couplé à une chimiothérapie : anti-B7H4- ADC), mécanismes d’action et identification de biomarqueurs. 

Elle poursuit également d’autres objectifs (objectifs secondaires) : 

• Cette recherche constitue une étude préclinique, c’est-à-dire qu’elle est une première étape préparatoire à un essai clinique de phase II dans l’endomètre basé sur les biomarqueurs identifiés, comparant le candidat médicament seul et en combinaison avec anti-PD1 dans les cancers de l’endomètre MSI (instabilité des microsatellites= défaut de réparation de l’ADN) et MSS (stabilité des microsatellites= réparation ADN normal)
• La validation du candidat médicament dans les cancers de l’endomètre permettra son extension à d’autres pathologies tumorales sur la base des biomarqueurs identifiés.

Le projet « TNBC Treg-TARGET » a pour objectif de valider in situ de nouvelles cibles permettant de neutraliser spécifiquement les Treg intra-tumoraux qui ont une forte activité suppressive de la réponse immune antitumorale et sont associés à un mauvais pronostic tout en évitant d’agir les Treg de la périphérie pour éviter la survenue de phénomènes auto-immuns sévères. Nous analyserons, la proportion et la localisation spatiale des Treg exprimant ces marqueurs d’intérêt et les cellules avec lesquels ils interagissent in situ. Ce projet est prévu pour une durée de 2 ans et nécessite l’utilisation d’échantillons biologiques (blocs FFPE de patientes présentant un cancer du sein triple négatif (TNBC) à la chirurgie) conservés dans le cadre du soin. Excepté le statut TNBC, requis pour la sélection des cas, nous n’avons pas besoin des données cliniques associées à ces échantillons

L'objectif principal de cette étude rétrospective est d'évaluer l’effet de la nutrition entérale sur la masse maigre chez des patients atteints de cancer.

Critère de jugement : la masse musculaire squelettique (SMI), mesurée environ 6 semaines après la nutrition entérale (± 2 semaines), à partir d’une image du scanner au niveau de la troisième vertèbre lombaire (L3).

Description grand public :

Nous souhaitons développer de nouveau modèles in vitro en 3D qui pourraient aider à tester la sensibilité de nouveaux agents thérapeutiques dans le cancers du sein luminaux A.

Évaluer le taux de complications postopératoires dans les 30 jours suivants la chirurgie (mastectomie sans reconstruction immédiate avec curage axillaire) chez les patientes ayant un cancer du sein inflammatoire traité par traitement systémique néoadjuvant (TSNA) associé ou non au Pembrolizumab.

Description grand public : 

Ce projet vise à mieux comprendre pourquoi certaines cellules cancéreuses du poumon résistent aux traitements par immunothérapie avant la chirurgie. En analysant ces cellules restantes, nous cherchons à identifier de nouvelles cibles pour des traitements innovants, plus précis et mieux adaptés à chaque patient. L’objectif final est d’améliorer l’efficacité des traitements et les chances de guérison. 

Description détaillée : 

L’immunothérapie néoadjuvante a récemment montré un bénéfice important chez les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC), en améliorant les réponses pathologiques et les taux de survie. Toutefois, une proportion significative de patients présente des cellules tumorales résiduelles après traitement, ce qui expose à un risque de récidive et témoigne de mécanismes de résistance encore mal compris. Ce projet a pour objectif de caractériser la composition cellulaire et les profils moléculaires des cellules tumorales et de leur microenvironnement après traitement par chimioimmunothérapie néoadjuvante. Pour cela, des échantillons tumoraux appariés (avant traitement et après chirurgie) seront analysés à l’aide de deux approches complémentaires : 

• Immunofluorescence Multiplex: cette technique permettra de phénotyper et de cartographier spatialement les populations cellulaires présentes dans la tumeur résiduelle, avec une attention particulière concernant les cellules tumorales résiduelles, ainsi que les phénotypes immunitaires associés. 

• Séquençage ARN (bulk RNA-seq) : réalisé sur les mêmes échantillons, il fournira une vision globale des altérations transcriptionnelles induites par le traitement. 

L’intégration des données phénotypiques (marqueurs de surface, type cellulaire) et transcriptomiques permettra d’identifier des cibles thérapeutiques originales, notamment des protéines de surface exprimées spécifiquement par les cellules résistantes. Ces cibles seront priorisées en vue d’un développement futur d’anticorps conjugués à des médicaments (ADC) ou d’anticorps bispécifiques, pour renforcer l’arsenal thérapeutique post-opératoire. 

Ce travail pourrait ainsi poser les bases du développement de traitements de précision ciblant les cellules persistantes après immunothérapie, avec pour finalité de réduire les rechutes et d’améliorer le pronostic des patients atteints de cancer du poumon.

Description grand public : 

Le projet consiste à valider la pertinence d’une liste de cibles thérapeutiques liées à la survie des patients avec un cancer du pancréas en utilisant l’intelligence artificielle. 

Description détaillée : 

Le projet consiste à valider la pertinence d’une liste de cibles thérapeutiques liées à la survie des patients PDAC de façon causale en utilisant l’intelligence artificielle. Le premier objectif sera la caractérisation du profil génomique (RNAseq, DNAseq) puis protéique (large multiplex immunofluorescence) de ces patients « late » avec 3 principaux buts : 1/ Etudier le lien entre l’expression de la cible et son impact sur la survie (OS/PFS) à l’aide d’analyses de Cox et de Kaplan-Meier. 2/ Une analyse multi-omics (DNAseq, RNAseq, 30-plex IF) sera réalisée en interne pour mieux appréhender l’hétérogénéité du cancer du pancréas, de comprendre le lien entre l’expression de la cible et l’environnement tumoral du pancréas, le lien avec la survie des patients et identifier des sous-populations d’intérêt par cible. Cette analyse pourra fournir des hypothèses sur des potentiels partenaires de combo avec les SoC. 3/ Construire un patient virtuel late-stage afin de trouver de nouvelles cibles thérapeutiques innovantes et identifier également la ou les meilleures sous-populations de patients qui seraient susceptibles de bénéficier d’un traitement dirigé contre ces cibles. L’obtention des données cliniques (historique des traitements, réponse au traitement, ligne de traitement, stade, grade de la pathologie ainsi que la survie sont indispensables pour répondre à ce premier objectif). Le second objectif est de définir des caractéristiques sanguines correspondant aux sous-populations de patients d’intérêt afin de faciliter par la suite leur recrutement dans un essai clinique. Pour se faire, environ 3000 protéines présentes dans le plasma de ces patients seront dosées en interne chez Servier. Ces données seront mises au regard des données générées sur le tissu afin de mieux comprendre le lien entre le microenvironnement tumoral et les aspects circulants. Processus de travail et délais : Dans un premier temps, l’objectif est pour tester la qualité des ARN et ADN extraits des tissus (core needle biopsies ou résections chirurgicales) sur la base de la valeur du RIN, DIN, des données d’absorbance ainsi que le DV200 sur 20 échantillons (tissus + sang total apparié). Cette étape (QC testing) sera décisive pour la suite du projet (Go/no Go décision). Au niveau des délais, si le QC testing est validé, l’objectif est d’obtenir les données génomiques en Q2 2025 afin de commencer l’analyse et la construction du patient virtuel late-stage dès Q3 2025. Pour le second objectif sur l’aspect circulant, une sélection des sous-populations d’intérêt est nécessaire avant le dosage des protéines dans le plasma et sera réalisé Q1 2026

Les gliomes diffus de grade 2 et 3 sont des tumeurs cérébrales rares affectant des patients jeunes. Ils se caractérisent par une croissance continue et une évolution inéluctable vers la transformation maligne, conduisant à une espérance de vie réduite (survie de 5 ans à plus de 15 ans). Le choix du moment et des modalités de traitement (radiothérapie, chimiothérapie) après la résection chirurgicale de la tumeur sont controversés. Du fait de la survie potentiellement longue des patients, il est primordial de proposer des stratégies de traitement adaptées au risque, en équilibrant l’efficacité et les effets secondaires à moyen et long terme des traitements, puisque ceux-ci peuvent avoir un impact négatif sur la qualité de vie et les fonctions cognitives des patients. Pour cela, il est important de pouvoir prédire de façon précise et fiable, à l’échelle individuelle, la réponse aux traitements, notamment de chimiothérapie. Pourtant, les cliniciens sont confrontés à une grande variabilité de réponse tumorale aux traitements au sein de sous-groupes biologiques homogènes. Pour répondre à cette problématique, les essais cliniques sont limités, notamment du fait de la rareté de la maladie et de la survie relativement longue des patients. Par ailleurs, peu de ces études disposent de l’ensemble des données moléculaires et d’imagerie les plus récentes. Bien que de nouvelles études soient conçues à la lumière des caractéristiques tumorales modernes, les résultats de celles-ci ne seront pas disponibles avant plusieurs années. La prise en compte de données cliniques, biologiques et radiologiques complètes des patients étant nécessaire pour permettre une prédiction plus fiable de la réponse tumorale et du devenir du patient, les séries rétrospectives de patients (c’est-à-dire, l’analyse à postériori des patients traités au cours des dernières années, voire décennies) sont très utiles. Malheureusement, il n’existe que peu de grandes séries de patients atteints d’un gliome diffus de grade 2 ou 3 associant ces données cliniques, radiologiques et biologiques complètes.

Grâce à l’expertise du Pr Duffau (CHU Montpellier) dans la chirurgie de ces tumeurs, l’Institut du Cancer de Montpellier (ICM) a traité un grand nombre de patients au cours des deux dernières décennies. Une base de données dédiée à ces tumeurs (BDD-NO) permet de récolter les données cliniques de ces patients. Les données d’imagerie (IRM cérébrales) sont également conservées et disponibles pour être analysées. Enfin, pour les patients ayant accepté l’utilisation à des fins de recherche de leur échantillons tumoral (prélevé au moment de la chirurgie de leur tumeur), ce matériel tissulaire est stocké au Centre de Ressources Biologiques (CRB) du CHU Montpellier.

Le but de l’étude GLIOPREDICT est d’analyser toutes les caractéristiques cliniques (âge des patients au diagnostic par exemple), biologiques (paramètres de biologie moléculaire, composition et organisation des cellules dans la tumeur), et radiologiques (volume de la tumeur, vitesse de croissance, caractéristiques avancées en imagerie) pour affiner la prédiction de la réponse tumorale à la chimiothérapie. Le but à terme est d’améliorer la stratégie de traitement pour chaque patient, en équilibrant l’efficacité du traitement sur la tumeur et ses effets indésirables à moyen et long-terme, pour préserver le plus longtemps possible les fonctions cognitives et la qualité de vie de ces jeunes patients.

Le cancer de la vessie est un cancer fréquent, représentant 7,5% de tous les cancers chez l'homme en Europe et 14000 nouveaux cas par an en France. Vingt-cinq pour cent de ces cas sont des tumeurs de vessie inifltrant le muscle (TVIM). Le traitement standard des TVIM est la cystectomie radicale avec lymphadénectomie pelvienne, précédée d'une chimiothérapie néoadjuvante à base de cisplatine pour les patients en bon état général.

La préservation de la vessie par un traitement trimodal (résection transurétrale de la tumeur de la vessie ou RTUV, radiothérapie et chimiothérapie) est une option intéressante pour les patients inopérables ou ne souhaitant de cystectomie. 

La particularité de la planification de la radiothérapie dans le cas des cancers de la vessie est de prendre en compte les changements de volume de la vessie entre les fractions. À cette fin, il est recommandé d’utiliser de grandes marges (environ 1,5 à 2 cm) entre le volume cible clinique (CTV, c'est-à-dire la vessie elle-même) et le volume cible de planification (PTV). 

La radiothérapie adaptative est la capacité de prendre en compte les éventuels changements de forme ou de volume survenant pour les volumes cibles et/ou les organes à risque (OAR) entre et/ou pendant les fractions de traitement, en adaptant le plan dosimétrique à ces changements. Différentes méthodes de radiothérapie « offline » ont été développées pour la radiothérapie du cancer de la vessie, utilisant par exemple une bibliothèque de plans ou une individualisation du plan sur des CBCT (Cone Beam Computer Tomography) acquis quotidiennement pour le positionnement du patient. 

La radiothérapie adaptative « online » (oaRT) permet de délimiter quotidiennement les volumes cibles et/ou OAR et d'adapter le plan lorsque le patient est sur la table de traitement. Le système ETHOS (Varian a Siemens Healthineers Company, USA) est un appareil de radiothérapie adaptative online  guidée par CBCT avec un système de planification de traitement intégré (TPS) permettant une oaRT quotidienne, adaptée à la radiothérapie des cancers de la vessie. 

L'objectif de notre étude était de présenter les premiers résultats cliniques de patients traités par oaRT quotidienne pour un MIBC, ainsi que les avantages dosimétriques de la technique.