Avec le projet SPARK, nous évaluerons la faisabilité d’utiliser le séquençage de l'ARN unicellulaire (scRNA-seq) dans un délai compatible avec la décision clinique et l'orientation thérapeutique, chez des patients atteints de tumeurs solides. Nous étudierons également son potentiel à guider les décisions de traitement en fonction de l'expression cible, de la cellule tumorale et de la caractérisation moléculaire du TME. Nous comparerons cette approche avec le profilage moléculaire plus large que nous mettons en œuvre dans le cadre de l’étude ProfiLER.

Cette recherche  part du constat clinique suivant : les cancers de l’endomètre restent une pathologie avec peu d’options thérapeutiques en particulier les cancers de type MSS et en cas de rechute (stabilité des microsatellites= réparation ADN normal). 

Son objectif principal est de mieux comprendre la biologie de la cible thérapeutique B7H4 (protéine à la surface des cellules tumorales) fortement exprimée dans les cancers de l’endomètre et les conséquences biologiques de son engament avec un candidat médicament (anticorps anti-B7H4 couplé à une chimiothérapie : anti-B7H4- ADC), mécanismes d’action et identification de biomarqueurs. 

Elle poursuit également d’autres objectifs (objectifs secondaires) : 

• Cette recherche constitue une étude préclinique, c’est-à-dire qu’elle est une première étape préparatoire à un essai clinique de phase II dans l’endomètre basé sur les biomarqueurs identifiés, comparant le candidat médicament seul et en combinaison avec anti-PD1 dans les cancers de l’endomètre MSI (instabilité des microsatellites= défaut de réparation de l’ADN) et MSS (stabilité des microsatellites= réparation ADN normal)
• La validation du candidat médicament dans les cancers de l’endomètre permettra son extension à d’autres pathologies tumorales sur la base des biomarqueurs identifiés.

Le projet « TNBC Treg-TARGET » a pour objectif de valider in situ de nouvelles cibles permettant de neutraliser spécifiquement les Treg intra-tumoraux qui ont une forte activité suppressive de la réponse immune antitumorale et sont associés à un mauvais pronostic tout en évitant d’agir les Treg de la périphérie pour éviter la survenue de phénomènes auto-immuns sévères. Nous analyserons, la proportion et la localisation spatiale des Treg exprimant ces marqueurs d’intérêt et les cellules avec lesquels ils interagissent in situ. Ce projet est prévu pour une durée de 2 ans et nécessite l’utilisation d’échantillons biologiques (blocs FFPE de patientes présentant un cancer du sein triple négatif (TNBC) à la chirurgie) conservés dans le cadre du soin. Excepté le statut TNBC, requis pour la sélection des cas, nous n’avons pas besoin des données cliniques associées à ces échantillons

L'objectif principal de cette étude rétrospective est d'évaluer l’effet de la nutrition entérale sur la masse maigre chez des patients atteints de cancer.

Critère de jugement : la masse musculaire squelettique (SMI), mesurée environ 6 semaines après la nutrition entérale (± 2 semaines), à partir d’une image du scanner au niveau de la troisième vertèbre lombaire (L3).

Description grand public :

Nous souhaitons développer de nouveau modèles in vitro en 3D qui pourraient aider à tester la sensibilité de nouveaux agents thérapeutiques dans le cancers du sein luminaux A.

Évaluer le taux de complications postopératoires dans les 30 jours suivants la chirurgie (mastectomie sans reconstruction immédiate avec curage axillaire) chez les patientes ayant un cancer du sein inflammatoire traité par traitement systémique néoadjuvant (TSNA) associé ou non au Pembrolizumab.

Description grand public : 

Ce projet vise à mieux comprendre pourquoi certaines cellules cancéreuses du poumon résistent aux traitements par immunothérapie avant la chirurgie. En analysant ces cellules restantes, nous cherchons à identifier de nouvelles cibles pour des traitements innovants, plus précis et mieux adaptés à chaque patient. L’objectif final est d’améliorer l’efficacité des traitements et les chances de guérison. 

Description détaillée : 

L’immunothérapie néoadjuvante a récemment montré un bénéfice important chez les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC), en améliorant les réponses pathologiques et les taux de survie. Toutefois, une proportion significative de patients présente des cellules tumorales résiduelles après traitement, ce qui expose à un risque de récidive et témoigne de mécanismes de résistance encore mal compris. Ce projet a pour objectif de caractériser la composition cellulaire et les profils moléculaires des cellules tumorales et de leur microenvironnement après traitement par chimioimmunothérapie néoadjuvante. Pour cela, des échantillons tumoraux appariés (avant traitement et après chirurgie) seront analysés à l’aide de deux approches complémentaires : 

• Immunofluorescence Multiplex: cette technique permettra de phénotyper et de cartographier spatialement les populations cellulaires présentes dans la tumeur résiduelle, avec une attention particulière concernant les cellules tumorales résiduelles, ainsi que les phénotypes immunitaires associés. 

• Séquençage ARN (bulk RNA-seq) : réalisé sur les mêmes échantillons, il fournira une vision globale des altérations transcriptionnelles induites par le traitement. 

L’intégration des données phénotypiques (marqueurs de surface, type cellulaire) et transcriptomiques permettra d’identifier des cibles thérapeutiques originales, notamment des protéines de surface exprimées spécifiquement par les cellules résistantes. Ces cibles seront priorisées en vue d’un développement futur d’anticorps conjugués à des médicaments (ADC) ou d’anticorps bispécifiques, pour renforcer l’arsenal thérapeutique post-opératoire. 

Ce travail pourrait ainsi poser les bases du développement de traitements de précision ciblant les cellules persistantes après immunothérapie, avec pour finalité de réduire les rechutes et d’améliorer le pronostic des patients atteints de cancer du poumon.

Description grand public : 

Le projet consiste à valider la pertinence d’une liste de cibles thérapeutiques liées à la survie des patients avec un cancer du pancréas en utilisant l’intelligence artificielle. 

Description détaillée : 

Le projet consiste à valider la pertinence d’une liste de cibles thérapeutiques liées à la survie des patients PDAC de façon causale en utilisant l’intelligence artificielle. Le premier objectif sera la caractérisation du profil génomique (RNAseq, DNAseq) puis protéique (large multiplex immunofluorescence) de ces patients « late » avec 3 principaux buts : 1/ Etudier le lien entre l’expression de la cible et son impact sur la survie (OS/PFS) à l’aide d’analyses de Cox et de Kaplan-Meier. 2/ Une analyse multi-omics (DNAseq, RNAseq, 30-plex IF) sera réalisée en interne pour mieux appréhender l’hétérogénéité du cancer du pancréas, de comprendre le lien entre l’expression de la cible et l’environnement tumoral du pancréas, le lien avec la survie des patients et identifier des sous-populations d’intérêt par cible. Cette analyse pourra fournir des hypothèses sur des potentiels partenaires de combo avec les SoC. 3/ Construire un patient virtuel late-stage afin de trouver de nouvelles cibles thérapeutiques innovantes et identifier également la ou les meilleures sous-populations de patients qui seraient susceptibles de bénéficier d’un traitement dirigé contre ces cibles. L’obtention des données cliniques (historique des traitements, réponse au traitement, ligne de traitement, stade, grade de la pathologie ainsi que la survie sont indispensables pour répondre à ce premier objectif). Le second objectif est de définir des caractéristiques sanguines correspondant aux sous-populations de patients d’intérêt afin de faciliter par la suite leur recrutement dans un essai clinique. Pour se faire, environ 3000 protéines présentes dans le plasma de ces patients seront dosées en interne chez Servier. Ces données seront mises au regard des données générées sur le tissu afin de mieux comprendre le lien entre le microenvironnement tumoral et les aspects circulants. Processus de travail et délais : Dans un premier temps, l’objectif est pour tester la qualité des ARN et ADN extraits des tissus (core needle biopsies ou résections chirurgicales) sur la base de la valeur du RIN, DIN, des données d’absorbance ainsi que le DV200 sur 20 échantillons (tissus + sang total apparié). Cette étape (QC testing) sera décisive pour la suite du projet (Go/no Go décision). Au niveau des délais, si le QC testing est validé, l’objectif est d’obtenir les données génomiques en Q2 2025 afin de commencer l’analyse et la construction du patient virtuel late-stage dès Q3 2025. Pour le second objectif sur l’aspect circulant, une sélection des sous-populations d’intérêt est nécessaire avant le dosage des protéines dans le plasma et sera réalisé Q1 2026

Le projet IMPACT (Imagerie pour la Meilleure Prise en charge des Adénocarcinomes digestifs via la Cartographie de l’hypoxie et du pH Tumoral) vise à améliorer la prise en charge des cancers digestifs (pancréas, foie et rectum), souvent diagnostiqués à un stade avancé. Ces pathologies, notamment les cancers du pancréas et du foie, figurent parmi les plus agressives, avec un taux de survie nette à 5 ans inférieur à 18 %. Leur incidence est par ailleurs en augmentation en France, malgré les traitements actuels.

L’objectif principal d’IMPACT est d’exploiter l’imagerie par résonance magnétique (IRM) pour cartographier l’hypoxie et mesurer le pH tumoral de façon non invasive, sans recours à des agents de contraste. Ces biomarqueurs avancés permettront d’identifier des sous-groupes de patients non répondeurs aux traitements classiques de chimiothérapie et de radiothérapie.

Le projet IMPACT repose sur trois axes clés :

1. Cartographie de l’hypoxie
2. Mesure du pH tumoral
3. Analyse radiomique 

Grâce à ces approches, IMPACT ambitionne de mieux caractériser le microenvironnement tumoral et d’élucider les mécanismes de radiorésistance observés chez de nombreux patients. 

Les carcinomes ovariens séreux de haut grade (HGSOC) sont les tumeurs gynécologiques les plus létales, en raison d’un diagnostic tardif (75% des cas) et d’une hétérogénéité tumorale marquée, tant au niveau génomique, cellulaire que du microenvironnement. Cette hétérogénéité limite la stratification des patientes et complique les décisions thérapeutiques.

Ce projet vise à développer une approche intégrée et non invasive pour caractériser l’hétérogénéité tumorale du cancer de l’ovaire via une analyse multimodale. L'objectif de cette étude est d’explorer l’intégration de l'IRM in vivo et ex vivo à l'histologie et aux évaluations moléculaires dans le cancer séreux de l’ovaire de haut grade permettant une meilleure stratification des patientes et une personnalisation des décisions thérapeutiques.