Cette étude s’intéresse aux cellules cancéreuses qui sont présents dans les liquides d’épanchement de la plèvre (autour du poumon) ou du péritoine (dans l’abdomen) qui peuvent dans certains cancers apparaitrent et entraîner un inconfort chez le patient (essoufflement, gonflement abdominale). L’objectif de SMART-effusion est d’isoler les cellules cancéreuses présentes dans les liquides afin de les analyser finement pour mieux comprendre leurs propriétés et à terme guider les traitements des patients.

Cette recherche  part du constat clinique suivant : les cancers de l’endomètre restent une pathologie avec peu d’options thérapeutiques en particulier les cancers de type MSS et en cas de rechute (stabilité des microsatellites= réparation ADN normal). 

Son objectif principal est de mieux comprendre la biologie de la cible thérapeutique B7H4 (protéine à la surface des cellules tumorales) fortement exprimée dans les cancers de l’endomètre et les conséquences biologiques de son engament avec un candidat médicament (anticorps anti-B7H4 couplé à une chimiothérapie : anti-B7H4- ADC), mécanismes d’action et identification de biomarqueurs. 

Elle poursuit également d’autres objectifs (objectifs secondaires) : 

• Cette recherche constitue une étude préclinique, c’est-à-dire qu’elle est une première étape préparatoire à un essai clinique de phase II dans l’endomètre basé sur les biomarqueurs identifiés, comparant le candidat médicament seul et en combinaison avec anti-PD1 dans les cancers de l’endomètre MSI (instabilité des microsatellites= défaut de réparation de l’ADN) et MSS (stabilité des microsatellites= réparation ADN normal)
• La validation du candidat médicament dans les cancers de l’endomètre permettra son extension à d’autres pathologies tumorales sur la base des biomarqueurs identifiés.

Le projet « TNBC Treg-TARGET » a pour objectif de valider in situ de nouvelles cibles permettant de neutraliser spécifiquement les Treg intra-tumoraux qui ont une forte activité suppressive de la réponse immune antitumorale et sont associés à un mauvais pronostic tout en évitant d’agir les Treg de la périphérie pour éviter la survenue de phénomènes auto-immuns sévères. Nous analyserons, la proportion et la localisation spatiale des Treg exprimant ces marqueurs d’intérêt et les cellules avec lesquels ils interagissent in situ. Ce projet est prévu pour une durée de 2 ans et nécessite l’utilisation d’échantillons biologiques (blocs FFPE de patientes présentant un cancer du sein triple négatif (TNBC) à la chirurgie) conservés dans le cadre du soin. Excepté le statut TNBC, requis pour la sélection des cas, nous n’avons pas besoin des données cliniques associées à ces échantillons

L'objectif principal de cette étude rétrospective est d'évaluer l’effet de la nutrition entérale sur la masse maigre chez des patients atteints de cancer.

Critère de jugement : la masse musculaire squelettique (SMI), mesurée environ 6 semaines après la nutrition entérale (± 2 semaines), à partir d’une image du scanner au niveau de la troisième vertèbre lombaire (L3).

Description grand public :

Nous souhaitons développer de nouveau modèles in vitro en 3D qui pourraient aider à tester la sensibilité de nouveaux agents thérapeutiques dans le cancers du sein luminaux A.

Évaluer le taux de complications postopératoires dans les 30 jours suivants la chirurgie (mastectomie sans reconstruction immédiate avec curage axillaire) chez les patientes ayant un cancer du sein inflammatoire traité par traitement systémique néoadjuvant (TSNA) associé ou non au Pembrolizumab.

Description grand public : 

Ce projet vise à mieux comprendre pourquoi certaines cellules cancéreuses du poumon résistent aux traitements par immunothérapie avant la chirurgie. En analysant ces cellules restantes, nous cherchons à identifier de nouvelles cibles pour des traitements innovants, plus précis et mieux adaptés à chaque patient. L’objectif final est d’améliorer l’efficacité des traitements et les chances de guérison. 

Description détaillée : 

L’immunothérapie néoadjuvante a récemment montré un bénéfice important chez les patients atteints de cancer du poumon non à petites cellules (NSCLC), en améliorant les réponses pathologiques et les taux de survie. Toutefois, une proportion significative de patients présente des cellules tumorales résiduelles après traitement, ce qui expose à un risque de récidive et témoigne de mécanismes de résistance encore mal compris. Ce projet a pour objectif de caractériser la composition cellulaire et les profils moléculaires des cellules tumorales et de leur microenvironnement après traitement par chimioimmunothérapie néoadjuvante. Pour cela, des échantillons tumoraux appariés (avant traitement et après chirurgie) seront analysés à l’aide de deux approches complémentaires : 

• Immunofluorescence Multiplex: cette technique permettra de phénotyper et de cartographier spatialement les populations cellulaires présentes dans la tumeur résiduelle, avec une attention particulière concernant les cellules tumorales résiduelles, ainsi que les phénotypes immunitaires associés. 

• Séquençage ARN (bulk RNA-seq) : réalisé sur les mêmes échantillons, il fournira une vision globale des altérations transcriptionnelles induites par le traitement. 

L’intégration des données phénotypiques (marqueurs de surface, type cellulaire) et transcriptomiques permettra d’identifier des cibles thérapeutiques originales, notamment des protéines de surface exprimées spécifiquement par les cellules résistantes. Ces cibles seront priorisées en vue d’un développement futur d’anticorps conjugués à des médicaments (ADC) ou d’anticorps bispécifiques, pour renforcer l’arsenal thérapeutique post-opératoire. 

Ce travail pourrait ainsi poser les bases du développement de traitements de précision ciblant les cellules persistantes après immunothérapie, avec pour finalité de réduire les rechutes et d’améliorer le pronostic des patients atteints de cancer du poumon.

Description grand public : 

Le projet consiste à valider la pertinence d’une liste de cibles thérapeutiques liées à la survie des patients avec un cancer du pancréas en utilisant l’intelligence artificielle. 

Description détaillée : 

Le projet consiste à valider la pertinence d’une liste de cibles thérapeutiques liées à la survie des patients PDAC de façon causale en utilisant l’intelligence artificielle. Le premier objectif sera la caractérisation du profil génomique (RNAseq, DNAseq) puis protéique (large multiplex immunofluorescence) de ces patients « late » avec 3 principaux buts : 1/ Etudier le lien entre l’expression de la cible et son impact sur la survie (OS/PFS) à l’aide d’analyses de Cox et de Kaplan-Meier. 2/ Une analyse multi-omics (DNAseq, RNAseq, 30-plex IF) sera réalisée en interne pour mieux appréhender l’hétérogénéité du cancer du pancréas, de comprendre le lien entre l’expression de la cible et l’environnement tumoral du pancréas, le lien avec la survie des patients et identifier des sous-populations d’intérêt par cible. Cette analyse pourra fournir des hypothèses sur des potentiels partenaires de combo avec les SoC. 3/ Construire un patient virtuel late-stage afin de trouver de nouvelles cibles thérapeutiques innovantes et identifier également la ou les meilleures sous-populations de patients qui seraient susceptibles de bénéficier d’un traitement dirigé contre ces cibles. L’obtention des données cliniques (historique des traitements, réponse au traitement, ligne de traitement, stade, grade de la pathologie ainsi que la survie sont indispensables pour répondre à ce premier objectif). Le second objectif est de définir des caractéristiques sanguines correspondant aux sous-populations de patients d’intérêt afin de faciliter par la suite leur recrutement dans un essai clinique. Pour se faire, environ 3000 protéines présentes dans le plasma de ces patients seront dosées en interne chez Servier. Ces données seront mises au regard des données générées sur le tissu afin de mieux comprendre le lien entre le microenvironnement tumoral et les aspects circulants. Processus de travail et délais : Dans un premier temps, l’objectif est pour tester la qualité des ARN et ADN extraits des tissus (core needle biopsies ou résections chirurgicales) sur la base de la valeur du RIN, DIN, des données d’absorbance ainsi que le DV200 sur 20 échantillons (tissus + sang total apparié). Cette étape (QC testing) sera décisive pour la suite du projet (Go/no Go décision). Au niveau des délais, si le QC testing est validé, l’objectif est d’obtenir les données génomiques en Q2 2025 afin de commencer l’analyse et la construction du patient virtuel late-stage dès Q3 2025. Pour le second objectif sur l’aspect circulant, une sélection des sous-populations d’intérêt est nécessaire avant le dosage des protéines dans le plasma et sera réalisé Q1 2026

Environ 30 % des nouveaux cas de cancer du poumon non à petites cellules (CPNPC) sont diagnostiqués à un stade localement avancé (c'est-à-dire au stade III) avec un faible taux de survie à 5 ans malgré les progrès thérapeutiques (13 à 36 % selon les différents sous-groupes IIIA, B ou C). Le CPNPC de stade III est une maladie hétérogène, et une stadification appropriée au moment du diagnostic, la sélection des patients, ainsi qu'une approche multidisciplinaire dans le processus décisionnel sont des facteurs clés qui influent sur le pronostic des patients.

Actuellement, le traitement standard du CPNPC localement avancé et inopérable est la chimioradiothérapie concomitante. Récemment, l'utilisation de l'immunothérapie de consolidation comme traitement supplémentaire a été approuvée et peut être considérée comme un tournant dans l'amélioration du parcours diagnostique et thérapeutique des patients atteints d'un CPNPC de stade III. En outre, les progrès récents en matière d'imagerie et d'apprentissage automatique basé sur des données multimodales pourraient contribuer à améliorer le diagnostic, la stratégie de traitement personnalisée et les résultats pour les patients.

Dans ce contexte, la société de soins de santé Johnson & Johnson vise à développer des algorithmes qui analysent les données d'imagerie et cliniques des patients atteints d'un CPNPC de stade III inopérable, afin d'améliorer la stratégie de traitement et les résultats pour les patients. À cette fin, les données complètes collectées dans le cadre du projet CIAN sur le cancer du poumon dans ce sous-groupe de population seront pseudonymisées et transférées à la société Johnson & Johnson pour analyse.

L'objectif scientifique de cette analyse secondaire est de développer des algorithmes pour le CPNPC de stade III inopérable, notamment la segmentation et la caractérisation automatisées des tumeurs et l'analyse prédictive des résultats pour les patients, tels que la survie sans progression (PFS) et la survie globale (OS).

Le cancer de l'endomètre (CE) est le cancer gynécologique le plus fréquent en Europe, avec une incidence d'environ 73 000 cas en 2020. Si la plupart des patientes sont diagnostiquées à un stade précoce, environ 20 % présentent déjà une maladie avancée lors du diagnostic, et près de 15 % feront une récidive*. La prise en charge repose sur une combinaison de chirurgie, de radiothérapie, de chimiothérapie et, plus récemment, d’immunothérapie. Toutefois, contrairement au cancer de l’ovaire pour lequel la chirurgie dite « cytoréductrice » est bien établie, son rôle précis dans les formes avancées ou récidivantes du cancer de l’endomètre reste mal connu. Les données actuelles proviennent essentiellement d'études rétrospectives* avec un faible effectif, et il n’existe pas de critères fiables pour identifier les patientes qui bénéficieraient le plus de cette approche. De plus, l’impact des caractéristiques moléculaires des tumeurs sur les résultats chirurgicaux n’a encore jamais été évalué.

Cette recherche a donc pour objectif d’identifier les critères cliniques permettant de prédire la possibilité d’une résection complète lors d’une chirurgie cytoréductrice chez des patientes atteintes d’un cancer de l’endomètre avancé ou récidivant. À plus long terme, cette étude vise à poser les bases pour mieux sélectionner les patientes susceptibles de bénéficier d’une chirurgie étendue, d’optimiser les indications et d’adapter les traitements postopératoires, dans l’intérêt des futures patientes