L’objectif de ce travail est de confirmer sur une plus grande cohorte les résultats retrouvés sur le RNAseq en recherchant la mutation M218V rs41277507 dans l’ADN tumoral et le sang de nos patients traités par immunothérapie.

Etudier en biologie moléculaire par un panel ADN ciblé un sous groupe rare mais de pronostic défavorable de lymphomes B diffus à grandes cellules : les double et triple HIT

Les récents progrès technologiques permettent aujourd’hui l'analyse simultanée de gènes ou portions de gènes d’intérêt via le séquençage à haut débit (NGS). La collecte de données sur les patients peut aider à élucider l'utilité clinique des thérapies ciblées, des tableaux de tumeurs moléculaires et du profilage génomique basé sur le NGS.

Dans ce contexte, WAYFIND-R est un registre mondial promu par Roche visant à :

- caractériser les traitements et l'évolution clinique des patients atteints de cancer ;

- fournir une plateforme de recherche de données pour évaluer les décisions de traitement et les résultats dans le monde réel

- soutenir la conception et la réalisation de recherches épidémiologiques et d'essais cliniques.

Le registre WAYFIND-R devrait être mis en place initialement dans 12 pays, puis devrait s’étendre à d’autres pays, dans des centres universitaires, des hôpitaux et des cliniques privées. WAYFIND-R vise à inclure près de 15 000 patients.

Contrairement à de nombreux registres de maladies, WAYFIND-R est mondial, prospectif, longitudinal (sur une période spécifique), généralisable (tous les tests NGS validés cliniquement, quelle que soit la taille du panel, sont autorisés), et comprend des tests NGS et une collecte de données standardisée pour améliorer la qualité des données et minimiser les données manquantes. WAYFIND-R inclut des adultes atteints de tout type/stade de tumeur solide dont le profil a été établi par NGS moins de 3 mois avant l'inclusion. L'un des éléments clés est la possibilité d'explorer les données mondiales et locales au sein d'une plateforme analytique sécurisée, à laquelle on accède par un tableau de bord visuel pour trouver des décisions de traitement pour des patients similaires ailleurs.

WAYFIND-R fournira donc des informations sur les meilleures pratiques pour les décisions de traitement basées sur le NGS par les cliniciens, encouragera les collaborations mondiales entre les centres anticancéreux, aidera à comprendre les disparités dans l'accès des patients aux diagnostics et aux thérapies avancées et, finalement, fera progresser l'oncologie de précision.

Evaluation des marqueurs biologiques de la réserve en follicules ovariens (AMH, FSH, oestradiol) avant et après expositions à un anti-PD1, au TDM1, ou à un anti-CDK4/6 chez des patientes âgées de moins de 45ans prise en charge pour un cancer du sein.

NB : Cette étude, réalisée à partir des éléments déjà renseignés dans le dossier médical conservé dans l'établissement de prise en charge, ne présente aucune contrainte ni aucun risque. En savoir + : voir note d'information ci dessous.

Les dossiers informatisés des patients contiennent un grand nombre d’examens réalisés en dehors de l’hôpital. Ces examens sont très souvent stockés sous forme d’images dans des fichiers PDF ou Word et dans un format non standardisé, ce qui empêche une extraction automatique des données. Le traitement de ces données est indispensable à la prise en charge des patients à l’hôpital. Nous souhaitons développer AMBER, un outil basé sur une nouvelle approche hybride utilisant le traitement de reconnaissance optique de caractères OCR avec le traitement du langage naturel NLP pour identifier et structurer les informations cliniques dans les photocopies numérisées des rapports de biopsies rédigés sous différents formats par plusieurs laboratoires.

Différents modèles d’intelligence artificielle et des méthodes de prétraitement d'image seront testés sur ces documents scannés, y compris ceux pouvant conduire à la création d'un système d’extraction automatique ne nécessitant pas d’annotation manuelle (processus chronophage et couteux). 

La performance d’AMBER sera évaluée en comparant les informations extraites automatiquement avec les données collectées manuellement par un médecin spécialiste à partir de rapports de biopsie en fichiers PDF et Word et avec les données collectées dans les cahiers d’observation de plusieurs études cliniques sur le cancer du sein et de la thyroïde. 

Notre objectif est de développer un outil qui permettrait une analyse et une structuration automatique rapide et précise des données dans les rapports de biopsie.

Objectif principal :

Développer et valider une nouvelle approche hybride utilisant le traitement de reconnaissance optique de caractères (OCR) et le langage naturel (NLP) pour structurer les données cliniques à partir des rapports de biopsie numérisées.

Objectifs secondaires :

Evaluer les risques d’erreur entre la pratique courante et le système automatique.

Evaluer le gain de temps généré par cet outil versus le recueil manuel de données. 

Déterminer la faisabilité et les avantages de la nouvelle approche et la meilleure façon d'intégrer ce système dans un flux de travail clinique quotidien.

Contexte :

Le cancer du sein est le premier cancer chez la femme. Le sous-type triple négatif représente 15% des cancers du sein. Depuis la publication de l’étude KEYNOTE-522, l'immunothérapie associée à la chimiothérapie néoadjuvante est devenue un standard pour les lésions T2 et/ou N+ triples négatives. L’immunothérapie néoadjuvante (IN) peut entraîner des effets indésirables très différents de la chimiothérapie néoadjuvante seule, parfois graves dont les conséquences sont encore mal connues. Le protocole initial de KEYNOTE-522 prévoyait une reprise de l’immunothérapie 2 semaines après la fin d’une radiothérapie adjuvante. Dans certains cas, afin d’éviter une récidive précoce de la maladie, l’immunothérapie a pu être reprise précocement, en concomitance avec la radiothérapie. Il existe actuellement très peu de données sur la tolérance de cette association dans cette situation.

Objectif principal : Evaluer la toxicité aigüe de la radiothérapie adjuvante après chimiothérapie ou chimio-immunothérapie néoadjuvante pour un cancer du sein triple négatif.

Objectifs secondaires : 

Comparaison de la tolérance d’une radiothérapie adjuvante en fonction d’une immunothérapie concomitante ou séquentielle après chimio-immunothérapie néoadjuvante dans les cancers du sein triple négatif.

Comparer la dose moyenne reçue par les muscles constricteurs du pharynx lors du traitement par radiothérapie des cancers ORL en fonction de l’utilisation ou non, de l'outil de planimétrie

a) Comparer les troubles de la déglutition radio-induits en fonction des groupes d’évaluationb) Evaluer la couverture des volumes cibles en fonction des groupes d’évaluationc) Evaluer les doses aux autres organes à risque principaux en fonction des groupes d’évaluationd) Evaluer la survie sans progression (PFS) et la survie globale (OS) en fonction du groupe d’évaluatione) Recherche de facteurs influençant la dose moyenne reçue par les muscles constricteurs du pharynxf) Recherche de facteurs influençant l’utilisation d’une sonde d’alimentation (à la fois la pose ou non, et sa durée d’utilisation)

 L’objectif principal de cette étude est de décrire en vie réelle le devenir des patients atteints de PMBL en rechute/réfractaire traités par immunothérapie anti-PD1, en monothérapie ou en combinaison avec d’autres traitements.

NB : Cette étude, réalisée à partir des éléments déjà renseignés dans le dossier médical conservé dans l'établissement de prise en charge, ne présente aucune contrainte ni aucun risque.

En savoir + : voir note d'information ci dessous.

• Déterminer s’il existe des caractéristiques spécifiques des patients ou des tumeurs associées aux polymorphismes de TPSAB1.
• Déterminer s’il existe un impact des polymorphismes de TPSAB1 sur la survie sans rechute et globale des patients traités pour un mélanome +/- métastatique.
• Déterminer s’il existe un impact des polymorphismes de TPSAB1 sur la survie sans rechute et globale des patients traités pour un mélanome +/- métastatique par immunothérapie, chimiothérapie et inhibiteurs de tyrosine kinase.
• Déterminer s’il existe une corrélation entre la toxicité liée à l’immunothérapie (IRR, IRAE) et les polymorphismes de TPSAB1.

Définir un PCI seuil au-delà duquel la survie sans récidive est supérieure à 12 mois

a) Morbidité chirurgicaleb) Corrélation entre le score PCI et la survie globalec) Comparaison des survies sans récidive et globale selon la quantité de carcinose (PCI score) coelioscopique après 6 cycles de CNA des patientes opérées et non opéréesd) Définir un PCI seuil au de la duquel la survie globale est supérieure ou égal à 24 mois