Le projet OCAS vise à personnaliser les traitements et améliorer les résultats cliniques des patientes atteintes de HGSOC, marquant une avancée dans les soins contre le cancer.

Évaluer les résultats oncologiques (survie globale et survie sans progression) chez les patientes subissant une exentération antérieure, postérieure ou totale pour cancer gynécologique (à l'exclusion du cancer de l'ovaire) au Centre Oscar Lambret.

- Décrire l'indication d'exentération antérieure, postérieure ou totale pour cancer gynécologique (hors cancer de l'ovaire) au Centre Oscar Lambret

- Décrire la technique chirurgicale (avec ou sans reconstruction)

- Décrire les résultats chirurgicaux (résection complète, taille de la lésion…).

- Évaluer la morbidité postopératoire, notamment les complications urétérales, et identifier les facteurs pronostiques influençant ces complications.

- Identifier les facteurs pronostiques de progression de la maladie ou de décès (SSP), en prenant en compte d'abord les facteurs connus avant la chirurgie, et ensuite les données postopératoires (résection complète).

Ce projet cible le carcinome séreux de haut grade de l'ovaire (HGSOC), qui se présente souvent à un stade avancé avec une réponse variable à la chimiothérapie néoadjuvante (NACT) suivie d'une chirurgie primaire différée (DPS). Malgré les traitements actuels, 39 % des patientes n'en tirent aucun bénéfice, soulignant la nécessité de meilleures approches thérapeutiques.

Le projet reconnaît la complexité du HGSOC, de ses volumes tumoraux métastatiques à la diversité génomique. L’objectif est d'améliorer les soins en identifiant des sous-populations avant traitement, notamment celles qui ne répondent pas à la NACT et qui pourraient bénéficier d'une chirurgie immédiate.

Contrairement aux études prédictives basées sur des données uniques comme l'imagerie CT, ce projet vise à utiliser des données multi-omiques (cliniques, chimiothérapie, CA-125, ctDNA, radiomiques) pour prédire la réponse volumétrique à la NACT.

OCAS s'articule autour de trois composantes principales :

• Développement d'un système d'autosegmentation : Utilisation de l'apprentissage profond sur des images annotées pour identifier les régions carcinomateuses, permettant une détection précoce des tumeurs et des stratégies personnalisées.
• Extraction de données radiomiques et pathomiques : Analyse des images segmentées pour obtenir des biomarqueurs précis et améliorer les pronostics et réponses au traitement.
• Identification de clusters distincts : Application de techniques d'apprentissage pour identifier des sous-groupes de patientes HGSOC, facilitant la médecine de précision.

Le projet OCAS vise à personnaliser les traitements et améliorer les résultats cliniques des patientes atteintes de HGSOC, marquant une avancée dans les soins contre le cancer.

L’objectif principal est de comparer les complications de grade ≥ 3 dans les 90 jours post-chirurgie entre les deux bras.

La survie globale et la survie sans progression constituent les objectifs secondaires de cette étude.

Objectif principal : Déterminer la faisabilité d'une évaluation de la scMRD dans le sang et la moelle des patients traités pour une LAM par de la chimiothérapie intensive grâce à l'utilisation de la technologie Tapestri®.

Objectifs secondaires : Comparer la technique de scMRD par Tapestri® avec la MRD NGS bulk (après enrichissement en cellules CD34+) dans le sang et la moelle.

L’objectif de cette étude est de réaliser une comparaison des résultats obtenus par la plateforme AURAGEN dans le cadre du programme FMG2025, pré-indications « Cancers et leucémies pédiatriques au diagnostic et en échec de traitement » avec les résultats obtenus à partir des analyses moléculaires réalisées durant le soin courant.

Principal : 

Evaluer la concordance entre les données issues d’un séquençage du génome entier (whole genome sequencing, WGS) et celles issues des analyses de soin courant (standard of care, SOC).

Secondaires :

- Décrire les discordances entre WGS et SOC

- Rapporter les autres anomalies moléculaires cliniquement relevantes rapportées par le WGS

- Analyse médico-économique

•Objectif principal : 

Comparer la survie sans progression (PFS) des patientes atteintes de carcinome ovarien épithélial de haut grade de stade III et IV ayant bénéficié d'un traitement par chimiothérapie entre celles ayant reçu un traitement de maintenance par bevacizumab versus celles ayant reçu du niraparib.

•Objectifs secondaires :

•A. Décrire la survie globale (OS) des deux groupes.

•B. Comparer les caractéristiques cliniques, biologiques et sociodémographiques des deux groupes.

CGI-Clinics vise à améliorer la médecine personnalisée en oncologie en optimisant l'interprétation des données génomiques (post-séquençage et avant de conseiller des thérapies ciblées compatibles). L'interprétation est un goulot d'étranglement pour le déploiement complet et la large accessibilité du séquençage de nouvelle génération (NGS) dans la gestion du cancer. Le projet s'attaque aux trois principaux obstacles à l'interprétation des mutations cancéreuses : elle n'est pas systématique, elle porte sur une majorité de variants dont la signification est inconnue et elle ne parvient pas à mobiliser les patients. 

L'interprétation des données génomiques des tumeurs repose sur le travail d'experts qui examinent des bases de données et des ressources éparses, dans un processus qui prend du temps et qui peut conduire à des décisions cliniques peu optimales. 

S'appuyant sur une plateforme d'apprentissage automatique systématique, CGI-Clinics vise à augmenter la part de variants interprétables dans les tumeurs (de 9-12% actuellement à au moins 50%), ainsi que des caractéristiques qui constituent des biomarqueurs de réponse aux médicaments. Notre projet d’analyse rétrospective au CLB a pour objectif d’évaluer indépendamment les performances de CGI-Clinics. 

La dystrophie musculaire de Duchenne se manifeste par une faiblesse musculaire qui apparait dans l’enfance, de manière progressive. Cette maladie génétique dite « rare », touchant 100 à 150 garçons nouveau-nés atteints de la myopathie de Duchenne chaque année et plus de 3000 personnes atteintes (Orphanet), résulte de la mutation du gène codant pour la dystrophine, une protéine essentielle à la survie de la fibre musculaire. L’espérance de vie des patients DMD est estimée à environ 30 ans. La recherche de nouveaux traitements pour guérir cette maladie est très active. 

La thérapie génique est une stratégie thérapeutique innovante qui consiste à apporter, via un vecteur viral AAV, un gène thérapeutique permettant de restaurer l’expression de la protéine absente chez le patient. Un essai clinique, mené par Généthon, est actuellement en cours. Lors de la phase I de détermination de dose, les premiers résultats de ce produit ont montré une bonne efficacité conduisant au passage de l’essai clinique en phase II (phase pivotale).

Afin d’évaluer l’expression du transgène, des biopsies musculaires sont réalisées chez les patients traités et différentes techniques (histologiques et moléculaires) ont été développées et qualifiées afin de quantifier le niveau d’expression du transgène (analyse ADN, protéique et immunohistochimique). Afin de déterminer le niveau d’expression du produit de thérapie génique par rapport à un niveau protéique endogène « normal », le laboratoire GENETHON a besoin d’échantillons biologiques de personnes contrôles. Le Centre de Ressources Biologiques du Centre Léon Bérard a été contacté pour la mise à disposition de tissus musculaires excisés pour diagnostic qui se sont avérés finalement non tumoraux.

L’objectif de ce projet est de caractériser la présence de notre cible (la Netrin-1) dans les cancers du rein chromophobe. Nous voulons d’une part étudier sa présence dans la tumeur primaire, et d’autre part dans les métastases. Ces analyses devraient nous permettre de définir si la Netrin-1 est un biomarqueur de la pathologie que nous pourrions cibler chez les patients à mauvais pronostiques (ie. métastatique) à l’aide traitement innovant.